بررسي تغييرات سطوح بياني ژن‌هاي ATM، POLM، TP53 در بافت معدۀ بيماران مبتلا به گاستريت و ارتباط آن با عفونت هليكوباكتر پيلوري

Evaluation of Gene Expression Alterations of ATM, TP53, and POLM in Gastric Biopsy Specimens of Patients with Gastritis and its Association with Helicobacter Pylori Infection

گاستريت يا ورم معده، يكي از رايج‌ترين بيماري‌هاي درگيركنندۀ معده است. عفونت با Helicobacter pylori مي‌تواند به آسيب‌هاي DNA و به دنبال آن، فعال شدن مسيرهاي ترميم DNA مستعد خطا منجر گردد كه متعاقب آن، تجمع آسيب‌ها در محل شكست‌هاي دو رشتۀ DNA و تشديد بي‌ثباتي ژنوم و تسهيل در روند ايجاد سرطان معده مي‌شود. در اين مطالعه، بيان ژن‌هاي ATM، POLM و TP53 كه در سيستم ترميم DNA و توقف چرخۀ سلولي نقش دارند، در مراحل پيش‌سرطاني معده بررسي گرديد. مواد و روش‌ها: از 180 نمونۀ بيوپسي جمع‌آوري‌شده، 30 نمونه كه گاستريت مزمن متوسط آلوده با هليكوباكتر پيلوري داشتند، به‌عنوان گروه مورد و 30 نمونه ديگر كه گاستريت مزمن خفيف بدون آلودگي با هليكوباكتر پيلوري داشتند، به‌عنوان گروه شاهد در نظر گرفته شدند. پس از استخراج RNA، ساخت cDNA انجام و بيان ژن‌هاي ATM، POLM و TP53 با روش Real Time PCR در دو گروه سنجيده گرديد. يافته‌هاي پژوهش: ژن‌هاي ATM، POLM و TP53 در گروه مورد نسبت به گروه شاهد، به ترتيب 07/4، 35/3 و 13/5 افزايش بيان در سطح نسخه‌برداري را نشان دادند. بحث و نتيجه‌گيري: درمجموع، ژن‌هاي ATM، POLM و TP53 بيان بالاتري را در گروه مورد نسبت به گروه شاهد نشان دادند كه ممكن است بيانگر فعال شدن اين ژن‌ها پس از عفونت هليكوباكتر پيلوري و به دنبال آن، فعال شدن مسير ترميم DNA مستعد خطا و نوتركيبي غيرهومولوگ شود.

Introduction: Gastritis is one of the most common diseases affecting the stomach. Helicobacter pylori infection could lead to DNA damage in gastric epithelial cells, followed by error-prone DNA repair pathways that increase the accumulation of damage at the site of DNA double-stranded breaks, exacerbate genome instability, and facilitate the emergence of gastric cancer. This study aimed to examine the expression level of ATM, POLM, and TP53 genes involving in the DNA Damage Response and the cell cycle arrest in the gastric precancerous stage. Materials & Methods: Among 180 gastric biopsy specimens, 30 samples taken from patients with moderate chronic gastritis infected by H. Pylori were regarded as the case group, and 30 other samples taken from non-infected patients with mild chronic gastritis were regarded as control. Following that, RNA extraction and cDNA synthesis was performed. Afterward, the expression levels of ATM, POLM, and TP53 genes were evaluated by the Real-Time PCR method. Ethics code: 98-02-27-43392 Findings: The ATM, POLM, and TP53 genes in the cases showed a 4.07, 3.35, and 5.13 increase in the gene expression at the transcriptional level, compared to the controls. Discussion & Conclusions: In general, ATM, POLM, and TP53 genes showed a higher increased expression level in the case group, compared to the controls, which might indicate the activation of noted genes after H. pylori infection. This may subsequently activate the error-prone DNA repair and non-homologous recombination pathways.