تغييرات بيان ژن‌ FOXE1 و lncRNA PTCSC2 در بافت‌هاي توموري در مقايسه با بافت‌هاي سالم در بيماران مبتلا به سرطان كولوركتال

Expression Changes of the FOXE1 and lncRNA PTCSC2 Expression in Tumor Tissues Compared with Normal Tissues in Patients with Colorectal Cancer

در مطالعات به متيلاسيون FOXE1 در سرطان كولوركتال پرداخته شده و از آن به‌عنوان يك بيوماركر تشخيصي نام برده شده است. در اين مطالعه براي اولين بار ارتباط بياني FOXE1 و lncRNA PTCSC2 در سرطان كولوركتال و هم‌چنين مقايسه الگوي بياني آن‌ها در دو بافت سالم و توموري افراد بيمار مورد مطالعه قرار گرفت. روش بررسي: در اين تحقيق از 40 نمونه بافت بيمار مبتلا به سرطان كولوركتال و 40 بافت نرمال استفاده شد. سپس استخراج Total RNA و در ادامه سنتز cDNA صورت گرفت. سپس ميزان رونوشت اختصاصي ژن­هاي lncRNA PTCSC2 و FOXE1 در دو بافت توموري و سالم مقايسه شد. نتايج حاصل به وسيله نرم­افزار GraphPad Prism مورد تحليل آماري قرار گرفت و جهت بررسي بيان lncRNA PTCSC2 و FOXE1 در گروه بيماران و سالم از آزمون T-test و نرم‌افزار پريزم استفاده شد و p كمتر از 0/05 به عنوان اختلاف معناداري در نظر گرفته شد. نتايج: سطح بيان FOXE1 به‌طور معني‌داري در نمونه‌هاي توموري كاهش نشان داد (0/005=P) درحاليكه سطح بيان lncRNA PTCSC2 در بافت توموري در مقايسه با بافت نرمال تغيير چشمگيري نداشت (0/65=P). به علاوه سطح بيان FOXE1 و lncRNA PTCSC2 ارتباط معناداري با پيشرفت بيماري و سن بيماران نشان نداد. نمودار ROC نشان داد كه ژن FOXE1 مي‌تواند به عنوان يك متغير مستقل به صورت نسبتاً مناسبي (0/03P=) ميان دو گروه بافت سالم و بيمار مورد مطالعه تغييرات بياني داشته باشد. نتيجه‌گيري: با توجه نتايج اين مطالعه، تغييرات بيان ژن FOXE1 در نمونه­ هاي توموري كاهش چشم گيري داشت و در سرطان كولوركتال مي­تواند به عنوان يك بيوماكر براي تشخيص تومور مورد استفاده قرار گيرد.

In recent studies, methylation of FOXE1 in colorectal cancer has been reported as a diagnostic biomarker. In this study for the first time, the expression of FOXE1 and PTCSC2 in colorectal cancer was investigated and their expression patterns in two healthy and tumor tissues of patients were compared. Methods: In this study, 40 tumor tissues with colorectal cancer and 40 adjacent normal samples were collected. Total RNA was extracted and cDNA synthesis followed. Then, the specific genes for lncRNA PTCSC2 and FOXE1 were amplified. The results were statistically analyzed by Graph Pad Prism software and a T-test was used to compare the expression levels of lncRNA PTCSC2 and FOXE1 in the patients and healthy group; p-value less than 0.05 was considered significant difference criteria. Results: In this study, the FOXE1 expression level was significantly decreased in tumor tissue (p-value = 0.005), whereas the lncRNA PTCSC2 expression level in tumor tissue was not significantly changed (p-value = 0.65). In addition, the expression levels of FOXE1 and lncRNA PTCSC2 did not show a significant relation with disease progression and age of the patients. ROC curve for changes in FOXE1 and lncRNA PTCSC2 expression showed that theFOXE1 gene could be a relatively appropriate independent variable (p-value = 0.03) to differentiate between the two study groups. Conclusion: According to the results of this study, changes in FOXE1 gene expression were significantly reduced in tumor samples and can be used as a biomarker in tumor diagnosis in colorectal cancer.