تعيين ساختار پروتئين و ارزيابي سطح بيان ژن Tup1 قارچ Zymoseptoria tritici

مقدمه: قارچ  Zymoseptoria tritici بيمارگر ديمورفي است كه تغيير در الگوي رشد آن نقشي اساسي در ايجاد بيماري دارد. به همين جهت، پروتئينTup1،كه يك سركوبگر رونويسي عمومي و تنظيم كننده شناخته شده اي براي تغيير شكل است، كانديداي واجد شرايط براي مطالعه مقدماتي در اين بيمارگر است.مواد و روش‏‏ها: با استفاده از Saccharomyces cerevisiae Tup1p  بعنوان مدل، دومين­هاي عملكردي پروتئين با استفاده از نرم افزار InterPro (Pfam) ترسيم شد. سپس ساختار سوم Zt.Tup1p توسط نرم افزار  InterPro (Pfam)نشان داده شد. سرانجام ، ميزان بيان Zt.Tup در شرايط in vitro  و in vivo توسط RealTime RTPCR ارزيابي شد.نتايج: پروتئين Zt.Tup1p داراي ساختارهاي عمومي موجود در در ساير پروتئين هاي يوكاريوتي شبهTup ، شامل دومين Nترمينال، منطقه مياني محافظت نشده و يك دومين C ترمينال با هفت تكرار WD است. همچنين نتايج نشان داد كه دو المنت غني از گلوتامين (Q1, Q2) موجود در S. cerevisiae، در ساختار Zt.Tup1p وجود ندارد. نتايج مشخص كردند كه بيان ژن Zt.tup1 در مرحله ميسليومي افزايش مي­يابد. بعلاوه افزايش بيان ژن در روزهاي 14 و 24 بعد از تلقيح به گياه نيز مشاهده شد.بحث و نتيجه‏گيري: وجود هفت تكرار WD محافظت شده در Zt.Tup1p و ساير قارچ هاي مرتبط نشان مي­دهد كه اين دومين­هاي عملكردي نقش مهمي در زندگي اين ميكروارگانيسم­ها دارند. با توجه به داده­هاي مطالعه حاضر، بيان بالاي ژن Zt.tup1 در مرحله ميسليوم نشان مي­دهد كه اين پروتئين ممكن است نقش مهمي در توسعه ميسليوم و تشكيل كونيدي داشته باشد.علاوه بر اين، افزايش بيان در زمان نكروتروفي كه با توسعه پيكنيدي مشخص مي شود، نشانگر اين است كه ژن ممكن است نقشي اساسي در رشد و بيماري­زايي Z. tritici داشته باشد.  مطالعه حاضر را مي­توان بعنوان شروع يك نظريه پردازي جديد و جامع براي شفاف سازي عملكردهاي دقيق اين ژن در طول رشد و بيماري زايي در نظر گرفت.