عنوان مقاله :
مطالعه رابطه تكاملي گندم نان و اجيلوپس تائوشي از طريق بررسي miRNA هاي مشترك و ژن هاي هدف آنها
عنوان به زبان ديگر :
Study of evolutionary relationship between bread wheat and Aegilops tauschii by analysis of common miRNAs and their target genes
پديد آورندگان :
براتي، مرتضي دانشگاه زنجان - دانشكده كشاورزي - گروه مهندسي توليد و ژنتيك گياهي، زنجان، ايران , عظيمي، محمدرضا دانشگاه زنجان - دانشكده كشاورزي - گروه مهندسي توليد و ژنتيك گياهي، زنجان، ايران , نقوي، محمدرضا دانشگاه تهران - پرديس كشاورزي و منابع طبيعي - گروه زراعت و اصلاح نباتات، تهران، ايران , محسني فرد، احسان دانشگاه زنجان - دانشكده كشاورزي - گروه مهندسي توليد و ژنتيك گياهي، زنجان، ايران
كليدواژه :
اجيلوپس , همرديفي , روش محاسباتي , RNA Seq
چكيده فارسي :
گندم (Triticum aestivum) يكي از گياهان مهم زراعي كشور و دنياست كه اهميت استراتژيك در تأمين غذاي انسان دارد. گندم نان يك آلوهگزاپلوئيد (AABBDD) است كه طي دو هيبريداسيون از اجداد وحشي خود به وجود آمده كه در آن اجيلوپس تائوشي بهعنوان دهنده ژنوم D گندم مطرح است. در اين تحقيق با استفاده از بررسي miRNAهاي مشترك آنها و ژنهاي هدف به رابطه تكاملي گندم نان و اجيلوپس تائوشي بيشتر پرداخته شده است. بررسي كروموزومهاي گندم نان و اجيلوپس تائوشي نشان ميدهد تا حدود زيادي كروموزومهاي متناظر از لحاظ طول و تعداد ژنها يكسان هستند. در اين مطالعه پنج miRNA رونوشتشده از ژنوم D گندم و مشترك با اجيلوپس تائوشي و همچنين سه miRNA جديد شناساييشده از RNA Seq به روش بيوانفورماتيكي مورد تجزيه و تحليل قرار گرفتند. همرديفي و بررسي تواليهاي miRNA موردنظر در گياهان تكلپه نشان داد كه اين miRNAها در گندم و اجيلوپس بيشترين تشابه را دارند و بهنظر ميرسد در طول تكامل، اين تواليها از اجيلوپس تائوشي بهصورت حفاظتشده به گندم رسيده است. بررسي آنتولوژي ژنهاي هدف miRNAهاي مشترك گندم نان و اجيلوپس تائوشي نشان از تشابه بالاي آنها داشت. بنابراين بهنظر ميرسد miRNAهاي مشترك بين گندم نان و اجيلوپس تائوشي تا حدود زيادي نقش و عملكرد مشابهي در اين گياهان خويشاوند دارند. يافتههاي اين تحقيق ميتواند در شناخت بهتر مكانيسم و عملكرد miRNAهاي گندم و اجيلوپس تائوشي و استفاده از آنها در طرحهاي اصلاحي گندم از طريق خويشاوند وحشي خود مورد بهرهبرداري قرار گيرد.