شناسايي خانواده ژني like -G2 و اعضاي كانديد در پاسخ به بيماري سفيدك پودري در گندم

In silico analysis of like - G2 gene family and identification of responsive members in wheat to powdery mildew infection

گندم يكي از مهم ترين گياهان زراعي در جهان و ايران محسوب مي شود و سفيدك پودري گندم، يكي از بيماري هاي مهم در گندم است كه خسارت قابل توجهي را به محصول وارد مي سازد. ژن هاي رمز كننده عوامل رونويسي، كانديداي مناسبي براي دست ورزي ژنتيكي و اصلاح ارقام - like مقاوم به تنش هاي محيطي مي باشند. اخيراً، مطالعات نشان داده است كه اعضاء خانواده ژني - like در گياهان در پاسخ به پاتوژنها نقش دارند. لذا به منظور، شناسايي اعضاء خانواده ژني G2 از G2-like در گندم نانوايي و پيش بيني عملكرد آن ها، اطلاعات مربوط به خانواده پروتئيني G2 جمع آوري شد. سپس، از اعضاي اين خانواده ژني در Ensmbl و TFDB پايگاههاي اطلاعاتي نظير برنج و آرابيدوپسيس بر عليه پروتئين ها و ژنوم گندم استفاده شد و پس از حذف توالي هاي تكراري، 87 مكان ژني رمزكننده 071 رونوشت پروتئيني شناسايي شد. درخت فيلوژني ترسيمي بر اساس توالي هاي پروتئيني اين خانواده ژني در گندم و 1 توالي پروتئيني شناخته شده در ساير گياهان با روش نزديك ترين همسايه ها، اين خانواده را به 1 گروه طبقه بندي نمود. بر اساس به ترتيب در فرايند هاي پاسخ به بيماري V و II ،I گروه بندي اعضاء، پيش بيني مي شود كه گروه سفيدك پودري، در رشد و توسعه كلروپلاست، پاسخ به تنش هاي زيستي و زمان گلدهي دخيل در يك G2- like هستند. پيش بيني موتيف ها در اين خانواده نشان داد كه اغلب اعضاء خانواده ژني گروه، شامل تركيبات موتيفي مشابهي هستند كه دلالت بر صحت گروه بندي در درخت فيلوژني و گندم روي G2-like عملكرد مشابه اعضاي يك گروه دارد. توزيع فراواني اعضاء خانواده ژني كروموزومها نشان داد كه اعضاء اين خانواده روي كليه كروموزوم هاي گندم وجود دارد. 3 و D 6 و كروموزوم هاي B بيشترين و كمترين تعداد اعضاء اين خانواده به ترتيب روي كروموزوم 3 قرار دارد. همچنين، تجزيه و تحليل ساختار ژن هاي آن ها نشان داد كه تعداد اينترون در A گروه ها از 1 تا 8 عدد متغير است.