عنوان مقاله :
تشخيص ويروس‌ها و ويروئيدهاي گياهي به كمك فناوري توالي يابي با توان بالا
عنوان به زبان ديگر :
Detection of plant pathogenic viruses and viroids using high throughput sequencing technology
پديد آورندگان :
علي سلطاني، ارغوان دانشگاه كيپ تاون - دانشكده پزشكي - گروه ويروس شناسي پزشكي، كيپ تاون، آفريقاي جنوبي , فرح بخش، فريده دانشگاه صنعتي اصفهان - دانشكده كشاورزي - گروه بيماري شناسي گياهي، اصفهان، ايران , لطفي، رضا دانشگاه تربيت مدرس - دانشكده كشاورزي - گروه بيوتكنولوژي، تهران، ايران , طالبي، مجيد دانشگاه صنعتي اصفهان - دانشكده كشاورزي - گروه بيوتكنولوژي، اصفهان، ايران
كليدواژه :
توالي يابي نسل بعد شناسايي , ويروس , ويروئيد , پلت فرم , آسيب شناسي گياهي
چكيده فارسي :
ويروس‌هاي گياهي باعث بسياري از بيماري‌هاي مهم مي‌شوند و مسئول كاهش عملكرد و كيفيت محصول در سراسر جهان هستند. شناسايي سريع و دقيق ويروس‌ها در يك نمونه براي سرويس‌هاي بازرسي، قرنطينه و مديريت بيماري مطلوب است. به‌تازگي، تكنيك‌هاي تعيين توالي نسل بعد (NGS) كه نمايانگر يك رويكرد انعطاف‌پذير در رديابي پاتوژن گياهي است، توسعه يافته است. از سال 2009، تكنيك‌هاي NGS در برخي نواحي ويروس شناسي گياهي متشكل از توالي‌يابي ژنوم ويروس يا ويروئيد، رديابي و شناسايي، اكولوژي و اپيدميولوژي آغاز به‌كار كرده است. تكنيك‌هاي NGS سريع، بسيار كارآمد و كم هزينه هستند و امكان توالي‌يابي چندين گيگابايت داده را در چند ساعت فراهم مي‌سازند. در واقع، يك رويكرد عمومي براي شناسايي ويروس يا ويروئيد است كه نيازي به شناخت قبلي از ميزبان يا ويروس ندارد. تنها با تعيين توالي كل آر.ان.اي‌هاي كوچك در يك اجراي NGS، شناسايي ويروس‌هاي داراي دي.ان.اي يا آر.ان.اي و ويروئيدها امكان‌پذير مي‌شود. در اين مقاله، به پيشرفت‌هاي اخير در به‌كارگيري تكنيك‌هاي NGS براي تشخيص ويروس‌ها و ويروئيدها در ميزبانان آن‌ها پرداخته شده است.
