ارزيابي تنوع ژنتيكي و تجزيه ارتباط براي صفات آگرومورفولوژيكي فلفل ISSR با استفاده از نشانگرهاي (Capsicum spp.)

Assessment of genetic diversity and association analysis for agro-morphological traits in pepper (Capsicum spp.) using ISSR markers

مطالعه تنوع ژنتيكي با استفاده از نشانگرها براي حفظ مؤثر ژرم‌پلاسم و درك ساختار ژنتيكي آن ضروري است. تغييرات ژنتيكي در يك گونه سازگاري آن به محيط‌هاي مختلف را تسهيل مي‌كند. در اين مطالعه تنوع ژنتيكي 114 ژنوتيپ از 30 توده‌ي فلفل (Capsicum) با 11 آغازگر ISSR و همچنين 14 صفت مورفولوژيكي بررسي گرديد. از 1653 جفت نشانگر ISSR، 04/7 درصد به طور معني‌دار (P≤0.01) در عدم تعادل پيوستگي (LD) بودند. در تجريه ساختار جمعيت بر اساس داده‌هاي مولكولي و با استفاده از مدل بيزين، 5 زيرجمعيت (K=5) شناسايي گرديد. در تجزيه ارتباط با استفاده از مدل خطي مخلوط و با لحاظ كردن ماتريس‌هاي Qst (ماتريس ساختار جمعيت) و K (ماتريس خويشاوندي افراد)، تعدادي از نشانگرهاي تكثير شده با 8 آغازگر ISSR با 13 صفت مورد بررسي پيوستگي نشان دادند. در بررسي حاضر، نشانگرهاي مشترك براي برخي صفات شناسايي گرديد كه حاصل اثرات پليوتروپي و يا پيوستگي نواحي ژنومي كنترل‌كننده صفات است. نشانگرهاي تكثير شده با آغازگر UBC834 بيشترين تعداد پيوستگي را با صفات مورد بررسي نشان دادند. نشانگرهاي شناسايي شده در صورت تأييد مي‌توانند در توسعه ارقام فلفل مفيد باشند.

Study of genetic diversity using genetic markers is necessary to effective conservation of germplasm and to understand its genetic structure. Genetic variability in a species facilitate its adaptation to various environmental conditions. In the present study, genetic variability among 114 genotypes from 30 Pepper accessions were studied suing 11 ISSR primers and 14 morphological traits. Of 1653 locus pairs of ISSR markers, 7.04% showed significant level (P≤0.01) of linkage disequilibrium (LD). By analyzing genetic structure of population based on molecular data and using Bayesian model, 5 subpopulations (K=5) were identified. Association analysis was conducted using mixed linear model by considering kinship and genetic structure matrices as covariates in the model. Some molecular markers multiplied by 8 ISSR primers were identified to be significantly associate with 13 studied traits (P ≤ 0.05). Some markers were common among some studied traits that can be due to pleiotropy or linkage between loci controlling traits. Among studied ISSR primers, molecular markers produced by UBC834 primer showed the most association with the studied traits. Identified markers after validation can be useful in the development of pepper cultivars.