رديابي گاماكروناويروس‌ها در بازار پرندگان زنده، تهران، 1399

Detection of Gammacoronaviruses from live bird markets, Tehran, 2020

ويروس برونشيت عفوني يك گاماكروناويروس است كه مسئول خسارات اقتصادي سنگين به صنعت پرورش طيور در سراسر جهان است. ماكيان (Gallus gallus) ميزبان طبيعي اصلي اين ويروس مي‌باشند اما كروناويروس‌هاي مشابه با ويروس برونشيت عفوني در گونه‌هاي مختلفي از پرندگان يافت مي‌شوند. به‌منظور تعيين نقش گونه‌هاي مختلف پرندگان در همه‌گيرشناسي ويروس برونشيت عفوني، مطالعه حاضر به رديابي گاماكروناويروس‌ها در بازار پرندگان تهران مي‌پردازد. سواب‌هاي كلوآك از سه گونه پرنده شامل ماكيان، اردك و بوقلمون اخذ شد، سپس RNA با استفاده از كيت استخراج CinnaPure استخراج و در نهايت DNA مكمل (cDNA) با استفاده از كيت RevertAid First strand ساخته شد. آزمون‌هاي واكنش زنجيره‌اي پليمراز به‌منظور تكثير ژن‌هاي اسپايك و نوكلئوكپسيد گاماكروناويروس‌ها مورد استفاده واقع شد. اين واكنش‌هاي زنجيره‌اي پليمراز موفق به رديابي ژن‌ اسپايك و ژن نوكلئوكپسيد گاماكروناويروس‌ها به ترتيب در 40 درصد از ماكيان و همچنين در 66/6 درﺻــﺪ از ﺑﻮﻗﻠﻤﻮنﻫــﺎ ﺷــﺪ. ﺗﺤﻠﯿــﻞ ﺷــﺠﺮه ﺷﻨﺎﺳــﯽ ﻧﺸــﺎن داد ﮔﺎﻣﺎﮐﺮوﻧﺎوﯾﺮوسﻫــﺎي ﯾﺎﻓــﺖ ﺷــﺪه در ﺑﻮﻗﻠﻤﻮنﻫـــﺎ ﺑﺴـــﯿﺎر ﻣﺸـــﺎﺑﻪ ﺗﯿـــﭗ 4/91 وﯾـــﺮوس ﺑﺮوﻧﺸـــﯿﺖ ﻋﻔـــﻮﻧﯽ ﻃﯿـــﻮر ﺑﻮدﻧـــﺪ. اﯾـــﻦ ﻣﻄﺎﻟﻌـــﻪ ﺑﯿـــﺎﻧﮕﺮ ﮔـــﺮدش ﮔﺎﻣﺎﮐﺮوﻧﺎوﯾﺮوسﻫــﺎ در ﮔﻮﻧــﻪﻫﺎي ﻣﺨﺘﻠــﻒ ﭘﺮﻧــﺪﮔﺎن در ﺑــﺎزار ﭘﺮﻧــﺪﮔﺎن ﻣــﯽﺑﺎﺷــﺪ ﮐــﻪ در ﻣﻄﺎﻟﻌــﺎت ﻫﻤﻪﮔﯿﺮﺷﻨﺎﺳــﯽ آﺗــﯽ ﺣـﺎﺋﺰ اﻫﻤﯿـﺖ اﺳـﺖ، ﻫﻤﭽﻨـﯿﻦ ﺑـﺮ ﻣﺒﻨـﺎي ﻧﺘـﺎﯾﺞ ﺑـﻪدﺳـﺖ آﻣـﺪه، ردﯾـﺎﺑﯽ ژن ﻧﻮﮐﻠﺌﻮﮐﭙﺴـﯿﺪ ﻧﺴـﺒﺖ ﺑـﻪ ژن اﺳـﭙﺎﯾﮏ ﺟﻬـﺖغربالگري گاماكروناويروس‌ها كارآمدتر مي‌باشد.

Infectious Bronchitis Virus is a Gammacoronavirus responsible for huge economic loss to poultry industry worldwide. Poultry (Gallus gallus) is the major host of the virus, but IBV-like coronaviruses can infect different species of birds. To determine the role of different bird species in infectious bronchitis virus epidemiology, this work was conducted to detect Gammacoronaviruses in Tehran live bird market. Cloacal swabs were collected from three bird species including poultry, duck and turkey; the RNA was extracted by CinnaPure isolation kit; subsequently the complementary DNA was synthetized by RevertAid First strand kit. Polymerase chain reactions targeting two genes of the nucleocapsid and the spike were run on complementary DNAs synthetized in the previous step. Polymerase chain reactions successfully detected the spike and the nucleocapsid genes in 40% of poultry and 66.6% of turkeys, respectively. Phylogenetic analysis showed that gammacoronaviruses detected in this work were closely related to infectious bronchitis virus type 4/91. This work also introduced the circulation of gammacoronaviruses in different bird species from a bird market, this issue could be significant in the future epidemiologic studies. The findings also described that the nucleocapsid gene detection is much more effective than the spike gene detection in terms of gammacoronavirus monitoring.