انگشت‌نگاري گونه‌هاي جنس آژيلوپس (Ageilops) با نشانگرهاي مبتني بر ژن‌هاي هدفمند و نواحي حفاظت شده CoRAP

Fingerprinting of Aegilops species using genes-targeted drived and conserved regiens CoRAP markers

گونه ­هاي جنس آژيلوپس (Ageilops) از گرامينه­ هاي مرتعي و يكي از مهمترين اجداد گندم و منبع غني از ژن­هاي تحمل به تنش­ هاست. بدين‌منظور انگشت‌نگاري روابط ژنتيكي توده ­هاي متعلق به هشت گونه ­ Ageilopsبا استفاده از نشانگرهاي مولكولي CoRAP مبتني بر ژن­هاي هدفمند مورد مطالعه قرار گرفت. در طراحي آغازگرهاي ثابت از شش ژن عامل تحمل تنش ­هاي غيرزيستي CAT، MnSoD، SoS1، miR398، miR160b و miR169gR استفاده شد. كمترين و بيشترين محتواي اطلاعات چندشكلي به­ترتيب مربوط به آغازگرهاي CoRAP2 و CoRAP10 با مقادير 92/0 و 96/0 بود. شاخص نشانگري در بين نشانگرهاي مورد بررسي از 89/6 در آغازگر CoRAP7 تا 49/13 در آغازگر CoRAP9 متغير بود. بين گونه­ ها جريان ژني (Nm) پايين و بعكس ميزان تمايز (Gst) بالايي مشاهده شد. همچنين مقدار شاخص Fst برابر با 45/0 نشان داد كه جمعيت­ هاي مورد مطالعه كاملاً از هم متمايز شده­ اند. با توجه به بالا بودن شاخص­هاي تعداد آلل مؤثر و تنوع ژنتيكي Nei، دو گونه Ae. cylandrica و Ae. caudata تنوع درون گونه­ اي بالايي در بين گونه ­هاي مورد بررسي نشان دادند. بيشترين تشابه بين دو گونهAe. truncialis و Ae. umbelulata و بين دو گونه Ae. neglecta و Ae. cylanrica مشاهده شد. تجزيه خوشه­ اي به‌طور مناسبي گونه­ ها را در گروه ­هاي مجزا تفكيك و تجزيه به مختصات اصلي نتايج تجزيه خوشه­ اي را تأييد كرد. با تجزيه ساختار جمعيت، نحوه جريان ژني و اختلاط ژنتيكي بين گونه­ ها مشخص شد كه در تطابق با نتايج تجزيه خوشه ­اي و نمودار دوبعدي PCoA بود.

Aegilops range grasses (Poaceae family) as one of the most important ancestors of wheat is a rich source of stresses tolerance genes. For this, the fingerprinting of genetic relationships in accessions belonging to eight species of Aegilops was studied using targeted genes-related CoRAP molecular markers. In designing the fixed primers, six genes CAT, MnSoD, SoS1, miR398, miR160b and miR169gR responsible for abiotic stresses tolerance were used. The lowest and highest polymorphic information contents were related to CoRAP2 and CoRAP10 primers with 0.92 and 0.96, respectively. The marker index varied from 6.89 in CoRAP7 primer to 13.49 in CoRAP9 primer. Low gene flow (Nm) and high differentiation (Gst) was observed between species. Also, the Fst index equal to 0.45 showed that the studied populations were completely separated. Due to the high values of the effective allele number and Nei genetic diversity, two species Ae. cylandrica and Ae. caudata showed high intra-specific diversity. The greatest similarity was observed between two species Ae. truncialis and Ae. umbelulata as well as Ae. neglecta and Ae. cylanrica. Cluster analysis appropriately divided species into distinct groups, and principal coordinate analysis confirmed the results of cluster analysis. Using structure analysis of the population, the mode of gene flow and genetic intermixture among species were in accordance with the grouping results of cluster analysis and PCoA biplot.