تجزيه‌و‌تحليل پروتئوم پيازچه درگونه‌هاي Allium stipitatum و A. scabriscapum ايراني براي شناسايي پروتئين‌هاي با بيان متفاوت

Comparison of forage yield and leaf area index of some local and foreign alfalfa (Medicago sativa L.) genotypes

جنس Allium شامل بيش از 920 گونه در سراسر جهان است. ايران زيستگاه اصلي بسياري از گونه­ هاي وحشي Allium مي­باشد. در اين مطالعه از بافت پيازچه دو گونه A. stipitatum و A. scabriscapum از دو زيرجنسMelanocrommyum و Reticulatobulbosa با هدف ارزيابي و شناسايي الگوي بياني پروتئين­هاي ذخيره­اي حاصل از روش SDS-PAGE استفاده شد. براي شناسايي لكه ­هاي پروتئيني و مشاهده تغييرات بياني دو گونه از الكتروفورز ژل دوبعدي و طيف‌سنجي جرميMALDI TOF/TOF MS استفاده گرديد. آناليز ژل ­هاي حاصل از الكتروفورز دوبعدي منجر به شناسايي 138 لكه پروتئيني شد. نتايج حاصل بيانگر شباهت اندك ميان ژل­ها و الگوي بياني متفاوت در بين نمونه ­ها بود كه بر اين اساس تعداد كمي لكه مشابه در هر دو ژل حاصل شد. نتايج نشان داد در پروفايل بياني پروتئين­ هاي بافت پيازچه اين نمونه­ها تفاوت­هاي معني­ داري وجود داشت كه با استفاده از آزمون T تعداد 9 لكه پروتئيني داراي بيشترين تغييرات معني­دار در سطح احتمال 5% شناسايي شدند و از بين آنها 3 لكه متفاوت با استفاده از روش­ طيف‌سنجي جرمي براي شناسايي انتخاب شد. نتايج آزمايش طيف‌سنجي جرمي و تطبيق داده ­هاي حاصل با پايگاه­ داده­هاي NCBI و Uniprot و ابزارهاي بيوانفورماتيكي مشخص كرد كه لكه­ هاي مورد آزمايش با پروتئين ­هاي Maturase k، Agmatine coumaroyltransferase-1 و يك پروتئين با عملكرد نامشخص بنام Hypothetical Protein مطابقت داشت. يافته­ هاي اين مطالعه نشان داد با توجه به اينكه نمونه­ هاي متعلق به دو گونه A.stipitatum و A. scabriscapum از يك جنس هستند اما الگوي بياني پروتئين­هاي ذخيره­اي آنها در بافت پيازچه بسيار متفاوت از يكديگر است.

This study was executed to compare forage yield and leaf area index of different alfalfa genotypes for two years and also, to estimate of leaf area index (LAI) via leaf weight and plant height during 2011 and 2012. Twenty local and foreign alfalfa genotypes were planted in a RCB design with three replications in spring, 2011 at Seed and Plant Research Institute (SPII), Karaj, Iran. Two-years analysis of variance indicated significant difference among genotype's means for fresh and dry forage yield in which Bami x Yazdi, Mesa sersa and KFA17 genotypes with average values of 41.99, 39.84 and 39.15 (t ha-1) fresh forage yield and 9.75, 9.41 and 9.16 (t ha-1) dry forage yield had the higher forage production, respectively. Despite the significant difference among genotypes for leaf to stem ratio, there was no significant difference for LAI. The results showed that the fast, accurate and low-cost estimation of LAI is possible through leaf weight and plant height. In this study, leaf weight trait (especially the fresh leaf weight) had more efficiency than plant height in estimating LAI through a linear model (without constant) with high coefficient of determination (R2 ≥ 94). It was concluded that every 100 g of fresh and dry leaf and 10 cm of plant height of alfalfa had 0.33, 1.51 and 0.25 m2 leaf area, respectively.