عنوان مقاله :
تشخيص نشانگرهاي زيستي سرطان: رويكرد سريع بيوانفورماتيك
عنوان به زبان ديگر :
فاقد عنوان
پديد آورندگان :
رزمجويي، مريم دانشگاه بين المللي امام خميني - دانشكده مهندسي،قزوين، ايران , حميدي، حميدرضا دانشگاه بين المللي امام خميني - دانشكده مهندسي، گروه مهندسي كامپيوتر، قزوين، ايران , ابراهيمي، اسماعيل دانشگاه بين المللي امام خميني - دانشكده مهندسي، گروه مهندسي كامپيوتر، قزوين، ايران
كليدواژه :
نشانگر زيستي , بيوانفورماتيك , سرطان سينه , الگوريتم موازي , الگوريتم ام.اس.وي.ام-اي.اف.اي
چكيده فارسي :
نشانگرهاي زيستي در تشخيص زودهنگام انوع بيماريها از جمله سرطان نقش عمدهاي دارند. بر اساس تعريف سازمان بهداشت جهاني، هر ساختار يا فرآيندي در بدن كه قابل اندازهگيري بوده و بر پيشبيني يا نتيجه بيماري اثرگذار باشد، بهعنوان نشانگر زيستي شناخته ميشود. امروزه شناسايي نشانگرهاي زيستي با استفاده از ابزارهاي بيوانفورماتيك امكانپذير است. مسئله تشخيص نشانگرهاي زيستي در حوزه بيوانفورماتيك بيشتر بهعنوان يك مسئله انتخاب ويژگي مطرح است. الگوريتمهاي انتخاب ويژگي متعددي در زمينه شناسايي نشانگرهاي زيستي مورد استفاده قرار ميگيرد. اما اين الگوريتمها يا از دقت كافي برخوردار نيستند و يا دقت لازم را داشته اما از پيچيدگي محاسباتي بالايي برخوردارند. به همين دليل الگوريتمهايي كه دقت بيشتري داشتهاند، تنها بهدليل زمانبر بودن كنار گذاشته ميشوند. هدف اصلي در اين پژوهش انتخاب الگوريتمي با دقت بالا در شناسايي نشانگرهاي زيستي است كه در نهايت با استفاده از شيوههاي موازيسازي، سرعت آن را بهبود بخشيم. الگوريتم انتخابي با استفاده از روشهاي موازيسازي باز طراحي شده است و با استفاده از دادهاي كه مربوط به سرطان سينه ميباشد، به ارزيابي روش پيشنهادي پرداختهايم. در نهايت الگوريتم توانسته است با همان دقت الگوريتم اصلي، ولي با افزايش سرعتي در حدود يك و نيم برابر، خروجي مورد نظر را توليد ميكند
چكيده لاتين :
no abstract
عنوان نشريه :
علوم رايانشي