بررسي بيوانفورماتيكي تاثير ليكوپن روي بيان پروتئين هاي شوك حرارتي (hsp27) در سرطان پروستات

Bioinformatics investigation of the effect of lycopene on the expression of heat shock proteins (hsp27) in prostate cancer

در بيشتر سرطان ها سطح بيان پروتئين هاي شوك حرارتي بالا مي رود كه سلول هاي سرطاني را نسبت به دارو درماني مقاوم و موجب پيش آگهي ضعيف مي گردد. همچنين ارتباط آنها با تكثير سلولي، تهاجم و متاستاز مشخص شده است. ليكوپن به عنوان يك كارتنوئيد از آنتي اكسيدانت هاي موثر است كه براي جلوگيري از رشد غده هاي سرطاني كار برد دارد. پروستات يكي ازشايع ترين سرطان هايي است كه در مردان ديده مي شود. براي درمان اين بيماري بيشتراز جراحي و شيمي درماني استفاده مي گردد كه عوارض متعدد بعد از درمان و هزينه بر است. براي اين مطالعه داده هاي خام ريز آرايه سرطان پروستات تحت تيمار ليكوپن و غير تيمار با حجم بالا از پايگاه NCBI بخش GEOدريافت شد. سپس تغييرات بيان پروتئين هاي شوك حرارتي(hsp27) با استفاده از ابزارها و روش هاي بيوانفورماتيكي، تعيين گرديد و مقايسه نتايج سطح بيان ژن هاي تيمار با ليكوپن نسبت به غير تيمار مشخص نمود كه سطح بيان نسبي ژن HSPB8 به شدت كاهش يافته و همچنين تغييرات قابل ملاحظه اي در سطح بيان ساير واريانت هاي اين ژن مشاهده نشد. اين نتايج نشان مي دهد كه ليكوپن مي تواند درسلولهاي سرطاني پروستات تنش ايجاد كند و با اين عمل سلولهاي سرطاني را به طرف آپويتوز هدايت كند.

In most cancers, the expression level of heat shock proteins is increased, which makes cancer cells resistant to drug therapy and has a poor prognosis. They have also been linked to cell proliferation, invasion and metastasis. Lycopene, as a carotenoid, is an effective antioxidant used to prevent the growth of cancerous glands. Prostate cancer is one of the most common cancers seen in men. To treat this disease, surgery and chemotherapy are mostly used, which have many complications after treatment and are costly. In this study, prostate cancer was treated with lycopene and raw microarray big data were received from GEO section of NCBI database. Then, the expression changes of heat shock proteins (hsp27) were determined using bioinformatics tools and methods, and comparing the expression levels of lycopene-treated genes with non-treated ones showed that the expression level of HSPB8 gene was drastically reduced and also, no significant changes were observed in the expression level of other gene families in this group. Results show that lycopene can cause stress in cancer cells and this stress predisposes the cell to apoptosis.