پديد آورندگان :
رحيم النجم، حيدر دانشگاه فني الفرات الاوسط - دانشكده فني المسيب - گروه فن آورهاي پرورش دام، بابل، عراق , عليجاني، صادق دانشگاه تبريز - دانشكده كشاورزي - گروه علوم دامي، تبريز، ايران , جوانمرد، آرش دانشگاه تبريز - دانشكده كشاورزي - گروه علوم دامي، تبريز، ايران , رافت، عباس دانشگاه تبريز - دانشكده كشاورزي - گروه علوم دامي، تبريز، ايران , حسنپور، كريم دانشگاه تبريز - دانشكده كشاورزي - گروه علوم دامي، تبريز، ايران
كليدواژه :
تنوع ژنتيكي , نشانگر ميكروساتلايت , گوسفند بومي عراقي , تنگناي ژنتيكي
چكيده فارسي :
هدف از پژوهش حاضر، تخمين شاخص هاي مولكولي، ساختار ژنتيكي، تنوع و تنگناي ژنتيكي در سه جمعيت گوسفند بومي عراق (عواسي، نعيمي و عرابي ) مي باشد. بدين منظور، از تعداد 12 جايگاه ميكروساتلايت با توزيع استقراركروموزمي (1، 2، 5، 9 و 14 ) وطبق توصيه فائو و انجمن ژنتيك جهاني استفاده شد. تعداد 60 نمونه خون كامل حيوان (نر و ماده ) به صورت تصادفي از جمعيت هاي مربوطه در استان هاي كربلا، نجف و بابل تهيه شد. استخراج DNA، تعيين كميت و كيفيت، واكنش زنجيره پلي مراز و الكتروفورز و عكس برداري با روش هاي متداول رايج انجام شد. از روش Allele Binning نيز براي تصحيح ژنوتيپ ها و به حد اقل رساندن خطاي قرائت ژنوتيپ استفاده شد. تعداد بيش از 9 نوع شاخص آماري مولكولي (فرواني اللي، تعداد آلل هاي مشاهده شده و مورد انتظار، هتروزايگوستي مشاهده شده و مورد انتظار، محتواي چند شكلي، ضريب رايت، شاخص شانون، شاخص هاي آماره F و فاصله ژنتيكي و وضعيت باتلنگ ) بررسي شد. نتايج در دو بخش بررسي مطلوبيت جايگاه ميكروساتلايت و ارزيابي تنوع ژنتيكي درون و بين جمعيتي ارائه شد. نتايج بخش اول نشان داد كه بيش ترين پلي مورفيسم در نشانگرهاي OarFCB226 و TGLA13 و بقيه كم ترين پلي مورفيسم را ايجاد مي كند. نتايج بخش دوم نشان داد كه به ترتيب نژاد عواسي و عرابي بيش ترين و كم ترين تنوع را دارد. بيش ترين فاصله ژنتيكي بين دو نژاد عرابي و نعيمي و كم ترين بين نعيمي وعواسي بود. منحني L-Shape باتلنك نشان داد كه جمعيت هاي مورد مطالعه در تنگناي ژنتيكي قرار دارند.
چكيده لاتين :
The aim of the present study was to estimate the molecular characteristics, structure, genetic diversity and genetic bottlenecks in the three sheep populations native to Iraq (Awassi, Naaimi, and Arabi). For this purpose, 12 microsatellite loci with chromosomal distribution distributions (1, 2, 5, 9 and 14) were used according to the recommendations of FAO and the International Society for Animal Genetics (ISAG). Sixty samples of whole animal blood (both sex) were randomly collected from the relevant populations in Karbala, Najaf and Babel provinces. The genomic DNA extraction, quality and quantity, preparation of PCR, electrophoresis photography was done accordingly based on standard available methods. After observation of raw genotype per investigated loci, allele binning was done for minimizing genotyping errors. More than 9 types of molecular statistical indices (allele frequencies, observed and effective number of alleles, observed and expected heterozygosity, PIC, Wright coefficient, Shannon index, F-statistical indices, genetic distance and the bottleneck) Checked out. The results were presented in two parts: evaluation of microsatellite loci utility and evaluation of genetic diversity within and between the population. The results of the first part showed that the highest polymorphism was observed in OarFCB226 and TGLA13 markers and the rest had the lowest polymorphism. The results of the second part showed that the Awaasi and Arabi breed have the highest and lowest diversity, respectively. The highest genetic distance was between Arabi and Naaimi breeds and the smallest was between Naaimi and Awassi breeds. Furthermore, bottleneck L-Shape curve showed that the studied populations are in a genetic predicament.
