توالي يابي ژن سيتوكروم اكسيداز در خط شناسه ژنتيكي ماهيان گورخري (Aphanius dispar) و آفانيوس سوفيه (Aphanius sophiae) جدا شده از آب هاي گرم در ايران

Sequencing of the cytochrome oxidase gene in DNA Barcoding of Aphanius dispar and Aphanius sophiae isolated from warm waters in Iran

اين تحقيق با هدف تعيين خط شناسه ژنتيكي ماهيان گورخري (Aphanius dispar)، آفانيوس سوفيه (Aphanius sophiae) جدا شده از آب ­هاي گرم در ايران انجام گرديده است. نمونه ­هاي ماهيان موردنظر از مناطق كولو (شهر اشكنان استان فارس)، چشمه گمبان (شهرستان ارسنجان)، جمع­ آوري شدند. بررسي مولكولي با استفاده از آغازگرهاي COI جهت خط شناسه ژنتيكي گونه ­هاي مورد مطالعه نشان داد كه گونه­ A. sophiae جدا شده از چشمه گمبان از لحاظ ژنتيكي بسيار نزديك به گونه Aphanius anatoliae، Aphanius maeandricus و هم چنين Aphanius sureyanus از كشور تركيه مي­ باشد كه خود را به ­صورت كلاستر جداگانه نشان دادند. اگرچه گونه dispar نيز با اختلاف ژنتيكي نزديك به هفت درصد خود را از اين گونه جدا و همراه با گونه sophiae يك كلاستر خواهري را در همين كلايد ايجاد كرده است. در همين حال دو گونه مورد بحث با اختلاف بسيار بالاتري نسبت به گونه­ هاي fasciatus و stiassnyae از كشورهاي پرتقال و ايتاليا به­ صورت يك كلايد جداگانه قابل توجه مي ­باشد. بيش ترين اختلاف ژنتيكي بين گونه fasciatus و sophiae به ميزان 21 درصد از كشور آلمان مشاهده گرديد و بسيار قابل توجه مي ­باشد كه با توجه به شكاف عميق جغرافيايي بين مناطق ياد شده دور از انتظار نبود. استفاده از آغازگرهاي مورد استفاده در اين تحقيق مي­ تواند در شناسايي تنوع ژنتيكي، باركدينگ و ارتباط منشا ژنتيكي گونه ­هاي هدف موثر باشد.

This research was performed in order to determine of DNA Barcoding of Aphanius dispar and Aphanius sophiae isolated from warm waters in Iran. Samples of the desired fish were collected from Kolo areas (Ashkanan city of Fars province), Gomban spring (Arsanjan city). Molecular study using COI primers for DNA Barcoding of the studied species showed that A. sophiae, isolated from Gomban spring are genetically very close to Aphanius anatoliae, Aphanius maeandricus and Aphanius sureyanus from Turkey, which have shown themselves as separate clusters. However, the dispar species, with a genetic difference of about seven percent, has separated itself from this species and, together with the sophiae species, has created a sister cluster in the same keyboard. At the same time, the two species in question, with a much higher difference than the fasciatus and stiassnyae species in Portugal and Italy, are distinct as a separate clade. The highest genetic difference between the fasciatus and sophiae species was observed in 21% of Germany, which is very significant, was not unexpected due to the deep geographical gap between the mentioned areas. The use of primers used in this research can be effective in identifying genetic diversity, barcoding and the relationship of genetic origin of the target species.