دسته‌بندي ژنتيكي ايزوله‌هاي استافيلوكوكوس اورئوس جدا شده از گوشت مرغ بر پايه ژن Spa

Genetic classification of Staphylococcus aureus strains isolated from raw chicken meat based on Spa gene

استافيلوكوكوس اورئوس يكي از شايع‌ترين عوامل مسموميت غذايي در انسان مي‌‌باشد. روش‌‌هاي مختلفي از جمله ژنوتايپينگ بر اساس پروتئين A (Spa typing) و روش‌‌هاي مبتني بر PCR جهت دسته بندي ژنتيكي اين باكتري به كار رفته است. در مطالعه حاضر از رديابي ژن Spa جهت ژنوتايپينگ ايزوله‌‌هاي استافيلوكوكوس اورئوس استفاده شد. مواد و روش‌ها: تعداد 100 نمونه گوشت خام مرغ از مراكز عرضه‌كننده گوشت مرغ در سطح بازار استان چهارمحال و بختياري، اخذ شد. نمونه‌ها جهت جستجوي باكتري استافيلوكوكوس اورئوس به روش كشت ميكروبي و مولكولي آزمايش و حضور ژن Spa در ايزوله‌هاي جدا شده به روش PCR و هضم آنزيمي جستجو شد. نتايج: از مجموع 23 ايزوله استافيلوكوكوس اورئوس مورد مطالعه، تعداد 6 ايزوله فاقد ژن Spa بودند. در بقيه ايزوله‌ها، قطعه‌اي با اندازه حدوداً 1100 تا 1500 جفت بازي رديابي شد كه بر اساس قطعه ژني رديابي شده، 17 ايزوله واجد ژن Spa در چهار ژنوتيپ I تا IV تقسيم‌بندي شدند؛ به طوري كه 9 ايزوله در ژنوتيپ SpaI، 3 ايزوله در ژنوتيپ II Spa، 3 ايزوله در ژنوتيپ SpaIIIو 2 ايزوله در ژنوتيپ Spa IV قرار گرفتند. نتيجه‌گيري: وجود تنوع ژنومي بالا در اين ايزوله‌ها نشانگر انتقال متقاطع آلودگي بوده و بنابراين، مي‌‌توان با اجراي استانداردهاي كنترل كيفيت و امنيت مواد غذايي در حين فرآيند توليد از حضور و رشد اين باكتري در مواد غذايي جلوگيري كرد.

Staphylococcus aureus is one of the most common causes of food poisoning in humans. Various methods including genotyping based on protein A (Spa typing) and PCR-based methods have been used for genetic classification of this bacterium. In the present study, Spa gene tracking was used for genotyping of Staphylococcus aureus isolates. Methods: 100 samples of raw chicken meat were collected from chicken meat supply centers in the market of Chaharmahal and Bakhtiari province. Samples were tested for Staphylococcus aureus bacteria by microbial culture and molecular methods and the presence of Spa gene in strains detected by PCR and enzymatic digestion. Results: Out of the total of 23 isolates of Staphylococcus aureus studied, 6 isolates lacked the Spa gene. In the rest of the isolates, a fragment with a size of about 1100 to 1500 bp was detected, and based on the detected gene fragment, 17 isolates containing the Spa gene were divided into four genotypes I to IV; So that 9 isolates were in SpaI genotype, 3 isolates in SpaII genotype, 3 isolates in SpaIII genotype and 2 isolates in SpaIV genotype. Conclusion: The presence of high genomic diversity in these isolates indicates cross-contamination of contamination and therefore can be prevented from the presence and growth of this bacterium in food by implementing quality control and food safety standards during the production process.