بررسي موردي حساسيت و توپولوژي گره‌هاي شبكه‌هاي بولي كاهش‌يافته

شبكه‌ها‌ي بولي يكي از مدل‌ها براي بررسي رفتارهاي ديناميكي پيچيده در سامانه‌هاي زيستي ‎‏است. تجزيه‌و‌تحليل جاذب‌هاي اين شبكه‌ها اهميت زيادي دارد. اما وابستگي نمايي اندازه‌ي گراف انتقال حالت اين مدل‌ها با تعداد گره‌هاي شبكه، مشكلي اساسي براي تحليل سامانه‌هاي بزرگ مقياس است. بنابراين استفاده از روش‌هاي كاهش شبكه ضروري است، زيرا اندازه‌ي شبكه‌ها كاهش مي‌يابد، در حالي‌كه خواص ديناميكي حفظ مي‌شود‏، اما روش‌هاي كاهشي مينيمال نيست. در اين مقاله ضمن آن‌كه دو شبكه‌‌ي زيستي آبسيزيك اسيد و سرطان سينه كاهش داده‌ شده‌است، هم‌چنين تحليل حساسيت گره‌هاي شبكه‌هاي كاهش‌يافته‌ انجام شده‌است. نتايج به‌دست‌آمده بيان‌گر اين موضوع است كه گره‌هاي شبكه‌هاي كاهش‌يافته، مؤلفه‌هاي مهمي در ديناميك شبكه‌ي اصلي‌اند. به‌دليل آن‌كه اكثر آن‌ها حساسيت مخالف صفر دارند‏، هم‌چنين گره‌هاي داراي حساسيت صفر در شبكه‌هاي كاهش‌يافته، با شرايط خاصي قابل حذف شدند. به عبارت ديگر، با استفاده از روش كاهشي و مفهوم حساسيت، روش پيش‌نهادي ما قادر به اصلاح روش كاهشي سعادتپور است. با استفاده از روش پيش‌نهادي شبكه‌هاي كاهش‌يافته‌‌اي با تعداد گره‌هاي كم‌تر به‌دست آورديم كه ديناميك شبكه‌ي اصلي را حفظ مي‌كنند و فضاي حالت كوچك‌تر ‏دارند. هم‌چنين گره‌هاي شبكه‌هاي كاهش‌يافته از دو جهت ساختاري و ديناميكي در شبكه‌هاي زيستي مهم‌اند.