تجزيه و تحليل بيوانفورماتيكي غني‌سازي مجموعه‌هاي ژني در حد فاصل مراحل تسهيم و بلاستوسيست ‏توسعه جنيني گاو با استفاده از داده‌هاي ريز آرايه ‏DNA

به منظور درك علل مرگ‌ومير و همچنين قابليت زنده ماني جنين گاو، شناخت مسيرهاي متابوليكي و الگوهاي بيان مجموعه ژني مرتبط با مراحل حد فاصل تسهيم و بلاستوسيت ضروري  به نظر مي رسد. با اين انگيزه در اين پژوهش مجموعه هاي ژني غني‌سازي شده از يك سلول تخم تا مرحله 16 سلولي و بلاستوسيست در توسعه جنيني گاو مورد بررسي قرار گرفت. بدين منظور، داده‌هاي خام ريزآرايه DNA از پايگاه داده GEO با دسترسي آزاد، پياده سازي شدند. سپس، كاوشگرهاي متفاوت بيان، با استفاده از نرم‌افزار برخط agriGO v2.0 و به روش تحليل غني‌سازي تكين (SEA)، غني‌سازي شدند. نتايج اين تحقيق به‌طور خلاصه، نشان داد كه در مجموع، تعداد 5 ژن؛ KPNA7، RGS2، TESC، MLLT11، BMP15 با افزايش بيان و همچنين، تعداد 5 ژن؛ KRT8، CLDN6، PLAC8، FN1، KRT18 با الگوي كاهش بيان، بيشترين ميزان تفاوت بيان را نشان دادند (P≤0.05). همچنين، در تجزيه و تحليل SEA، 39 مجموعه ژني در مسير فرآيندهاي زيستي از جمله متابوليسم NADP، tRNA، ATP، و كاتابوليسم فسفوليپيدها، آپوپتوز و رشد سلول، گليكوليز، ميتوز، تعداد 13 مجموعه ژني در مسير عملكردهاي مولكولي مختلف شامل يون منگنز، rRNA، فعاليت هاي اكسيداسيون سيتوكرومC، فاكتور آغازين ترجمه، ATP و فعاليت ATPase و در سطح مولفه هاي سلولي 12 مجموعه ژني از جمله غشاي وزيكول هاي سيتوپلاسم، غشاي شبكه اندوپلاسميك، ميكروتوبول و اسپيندل ها و غشاي پلاسمائي بيشترين غني‌سازي (P≤0.05) را نشان دادند. به‌عنوان نتيجه‌گيري كلي، مجموعه هاي ژني غني‌سازي شده در بلاستوسيست نشان‌دهنده، آغاز فرآيند تمايز بين سلول‌ها و انتقال از حالت بلاستوسيست به سمت فرايند لانه گزيني است. در نهايت، چنين به نظر مي‌رسد كه تفاوت الگوي بيان مجموعه هاي ژني و برهمكنش آن ها در اين مرحله احتمالاً به زنده‌ماندن يا تحليل جنين ختم مي شود.