ساختار و بيان ژن NFX در مراحل رشدي در گونه هاي جو، ذرت و گندم

مقدمه و هدف: پروتئين هاي NFXL1 و NFXL2 داراي موتيف هاي انگشت روي شامل (موتيف اتصال DNA و انگشت (PHD هستند كه به طور بالقوه برهم كنش پروتئين را واسطه گري مي كنند. ژن هاي NFX نقش مهمي در پاسخ به سيگنالينگ دفاعي با استفاده از هورمون هاي گياهي دارد. مواد و روش ها: در اين مطالعه، 12 ژن NFX در جو، ذرت و گندم انتخاب شدند. ساختار ژن، الگوهاي دوبرابرشدگي و درخت فيلوژنتيك براي 12 فاكتور رونويسي NFX در سه گونه مورد آناليز قرار گرفت. همچنين، تجزيه و تحليل مقايسه اي براي شناسايي ارتولوگ ها و پارالوگ هاي NFX در ژنوم ذرت، جو و گندم انجام شد. يافته ها: درخت فيلوژنتيك NFX از جو و ذرت و گندم به دو گروه تقسيم بندي شدند. آناليز ساختاز ژني نشان داد كه تعداد اگزون ژن هاي NFX بين 1 تا 13متغير است. آناليز سينتني ژن هاي NFX جو، ذرت و گندم نشان داد كه شباهت TaNFXL1.2 با HvNFXL1و HvNFXL2 باTaNFXL1.3 ، TaNFXL2،TaNFXL2.1 و ZmNFXL1 با ZmNFXL1.1 بيش از 90٪ مي باشد. آناليز ژن هاي NFX نشان داد كه دوبرابرشدگي تاندوم و دوبرابرشدگي سگمنتال نقش مهمي در گسترش ژنوم جو و ذرت و گندم دارد. با اين حال، تعداد دوبرابرشدگي تاندوم و سگمنتال، نشان داد كه اين عوامل از عوامل اصلي در تكامل ژن هاي NFX هستند. اين اولين مطالعه براي مقايسه ژن هاي NFX در سه گونه گياهي است،. پيش بيني عناصر تنظيمي نشان داد كهNFYC ،NFYB ،NFYA ، bHLH ، myb / SANT ، WRKY ، Dof و Trihelix بالاترين فراواني را در ناحيه آغازگر ژن هاي NFX داشتند. ژن هاي HvNFX2 و ZmNFX2 و TaNFX2 بالاترين تعداد سيس المنت ها را به خود اختصاص دادند. آناليز بيان ژن هاي NFX نشان داد كه اين ژن ها تقريبا در تمامي مراحل رشدي افزايش بيان نشان دادند. نتيجه گيري: يافته هاي ما مي تواند به عنوان منبع مفيدي براي مطالعات آينده ژن هاي NFX در مطالعات مقايسه اي بين گونه هاي مختلف گياهي در نظر گرفته شود. هدف از اين مطالعه، شناسايي و توصيف ژن هاي NFX در سه گونه از طريق روش تجزيه و تحليل ژنوم بود. ژن هايHvNFX1 ، HvNFX2 و ZmNFXL1.1 بيان ژن را در تمام مراحل رشدي نشان دادند. ساختار ژن در اكثر پروتئين هاي هر گروه مشابه بود كه با طبقه بندي فيلوژنتيك ژن هاي NFX مطابق بود.