شناسايي بيوانفورماتيكي شبكه تنظيمي mRNA-miRNA دخيل در تهاجم سرطان ريه

زمينه و هدف: در طول 15 سال گذشته، بينش قابل توجهي در مورد نقش miRNAها در سرطان حاصل شده است. در سرطان هاي مختلف، miRNAها مي توانند به عنوان آنكوژن يا سركوب كننده تومور عمل كنند و يا با تنظيم بيان ژن‌هاي هدف متعدد، فرآيند متاستاز را كنترل نمايند. لذا هدف از اين مطالعه شناسايي بيوانفورماتيكي شبكه تنظيمي mRNA-miRNA دخيل در تهاجم سرطان ريه بود.روش بررسي: در اين مطالعه تجربي كه در سال1400 انجام شد پروفايل بياني ژن هاي بيماران مبتلا به سرطان ريه، از داده هاي RNAseq موجود در پايگاه داده اطلس ژنوم سرطان (TCGA) با استفاده از پكيج TCGAbiolinks تهيه شد. mRNAها و miRNAها با بيان متفاوت با استفاده از پكيج هاي edgeR و limma در نرم افزار R شناسايي شدند و در ادامه با كمك دو پايگاه TargetScan و miRWalk، اهداف آنها پيش بيني شد. متعاقباً، شبكه تنظيم‌كننده تعامل miRNA-mRNA با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape به تصوير كشيده شد. داده‌‌هاي جمع‌آوري شده با استفاده از آزمون‌هاي فرض چندگانه(Multiple hypothesis testing)و ميزان كشف اشتباه (False Discovery Rate) تجزيه و تحليل شدند. يافته‌ها: نتايج بيوانفورماتيكي شناسايي شبكه تنظيمي miRNA-mRNA اختصاصي تهاجم سرطان ريه، نشان داد كه شش miRNA هاب، شامل؛ hsalet-7c-5p، hsalet-7b-5p، hsalet-7e-5p، hsa-miR-68385p، hsa-miR-320b و hsa-miR-4458تنظيم كننده ژن هاي افزايش يافته در وضعيت تهاجم ريه و چهار miRNA هاب، تنظيم كننده ژن هاي كاهش يافته در اين وضعيت، شامل؛ hsa-miR-92a3p، hsa-miR-2045p، hsa-miR-243p و hsa-miR-5063P مي باشند. نتيجه گيري: يافته‌هاي مطالعه حاضر نشان مي‌دهد كه يك شبكه miRNA-mRNA خاص با تهاجم سرطان ريه مرتبط است كه اين بينش جديد در مورد مكانيسم مولكولي تهاجم سرطان ريه به شناسايي بيوماركرهاي مولكولي و اهداف درماني براي اين بدخيمي مي انجامد. miRNAmRNA،