بررسي دو روش فنل-كلروفرم و استفاده از نانوذرات مغناطيسي جهت استخراج DNA ژنومي باكتري استافيلوكوكوس اورئوس

زمينه و هدف: جدا كردن DNA ژنومي از سلول‍هاي باكتريايي از جمله فرايندهايي است كه به طور معمول در اكثر آزمايشگاه‌هاي بيولوژيك انجام مي‌گيرد، لذا براي آن روش‌هاي گوناگوني ارائه شده است. در اين مطالعه از دو روش فنل و كلروفرم، و استفاده از نانوذرات مغناطيسي در جهت استخراجDNA  ژنومي باكتري استافيلوكوكوس اورئوس استفاده شده است. مواد و روش ها: در مطالعه حاضر از باكتري استافيلوكوكوس اورئوس سويه استاندارد به شماره ATCC 25923 استفاده گرديد. جهت استخراج DNA ژنومي از دو روش فنل-كلروفرم و استخراج به وسيله نانوذرات مغناطيسي استفاده شد. جهت بررسي كيفيت و غلظت DNA استخراج شده با دو روش فوق از دستگاه نانودراپ و روش الكتروفورز روي ژل آگارز استفاده گرديد. يافته‌ها: بررسي غلظت DNA استخراج شده در هر دو روش، توسط نانودراپ انجام شد كه غلظت DNA استخراج شده در روش فنل-كلروفرم و استفاده از نانوذرات مغناطيسي Fe3O4/SiO2  به ترتيب 550.4 و 131.6 ميكروگرم بر ميلي ليتر به دست آمد. بحث و نتيجه گيري: از يافته‌هاي اين تحقيق  مي‌توان نتيجه گرفت كه با توجه به ديواره‌ ضخيم باكتري استافيلوكوكوس اورئوس، استخراج DNA ژنومي به وسيله نانوذرات مغناطيسي Fe3O4/SiO2 داراي غلظت و خلوصي قابل قبول براي انجام پروسه هاي مولكولي مانند PCR است و مي‌تواند به عنوان جايگزين ساير روش هاي استخراج استفاده شود.