عنوان مقاله :
تعيين توالي DNA با استفاده از نانومنفذ عاملدار گرافين: مطالعه ديناميك مولكولي
پديد آورندگان :
محمدي ، محمدمهدي دانشگاه صنعتي شيراز - دانشكده مهندسي مكانيك , باوي ، اميد دانشگاه صنعتي شيراز - دانشكده مهندسي مكانيك , جمالي ، يوسف دانشگاه تربيت مدرس - دانشكده علوم رياضي
كليدواژه :
نانومنفذ , گرافين , توالي يابي DNA , ديناميك مولكولي هدايت شده , تمايز
چكيده فارسي :
در اين تحقيق امكان تعيين توالي تكرشته DNA حين عبور از نانومنفذ عاملدار صفحات گرافيني با استفاده از شبيهسازي ديناميك مولكولي هدايت شده در سرعت ثابت بررسي شده است. جهت عاملدار كردن نانومنفذ، از اتمهاي هيدروژن و گروه هيدروكسيل استفاده شده است. حين عبور تك رشته DNA، نيروي مورد نياز براي حركت DNA به اتم فسفر ستون فقرات آن اعمال ميشود و سپس تغييرات نيرو جهت تشخيص تمايز بين بازها بررسي شده است. همچنين، بروز تغييرات در زوايه صفحه باز نسبت به صفحه گرافين، كه زاويه بتا ناميده ميشود، حين عبور DNA از نانومنفذ بررسي شده است. نتايج نشان ميدهد كه با استفاده از اين ساختار و بررسي پارامترهاي مورد تحقيق، مولكولهاي سيتوزين، گوانين و تيمين با استفاده از اين روش قابل تمايز هستند. اين اميد وجود دارد كه با به خدمت گرفتن قابليتهاي اين روش و توجه بيشتر به پتانسيلهاي منحصر به فرد نانوساختارهاي حالت جامد دوبعدي، افقي نو براي طراحي نسل جديد ماشينهاي توالييابي پروتئينها در ديد محققان پروژه كلان ژنوم شناسي انساني بگشايد.
عنوان نشريه :
مهندسي مكانيك دانشگاه تبريز
عنوان نشريه :
مهندسي مكانيك دانشگاه تبريز