تنوع ژنتيكي جدايه‏ هاي گونه Colletotrichum fructicola با استفاده از نشانگر مولكولي ISSR و بررسي كارآمدي اين تكنيك در تفكيك اين گونه از برخي از گونه ‏هاي جنس Colletotrichum

در اين پژوهش تنوع ژنتيكي 70 جدايه Colletotrichum fructicola بدست آمده از علايم لكه‌برگي روي انواع گياهان اهلي و وحشي در مناطق مختلف سه استان شمالي ايران شامل گيلان، مازندران و گلستان با استفاده از نشانگر مولكولي ISSR بررسي شد. تجزيه و تحليل خوشه ‏اي نتايج حاصل از انگشت‏ نگاري DNA با استفاده از پنج آغازگر ISSR براي 70 جدايه‏ C. fructicola به خوبي توانست روابط ژنتيكي بين جدايه‏ ها را نشان دهد. بر اين اساس تعداد 70 جدايه در قالب هشت دودمان همسانه اي از هم تفكيك شدند. اين نتايج نشان داد تنوع ژنتيكي زيادي بين جدايه‏ هاي اين گونه قارچي وجود دارد. هيچ ارتباط مستقيمي بين گروه‏ هاي انگشت ‏نگاري DNA و منشاء جغرافيايي و ميزباني جدايه ‏ها مشاهده نشد. به منظور ارزيابي كارآمدي نشانگر مولكولي ISSR در تمايز و تفكيك جدايه هاي C. fructicola از جدايه هاي، برخي گونه‏ هاي نزديك و غالب جنس Colletotrichum، انگشت نگاري DNA با استفاده از اين نشانگر مولكولي براي 89 جدايه شامل 85 جدايه C. fructicola، دو جدايه C. gloeosporioides، يك جدايه C. aenigma و يك جدايه C. karstii انجام شد. بر اساس مقايسه الگوي انگشت‌نگاري DNA و فنوگرام ترسيم شده تعداد 89 جدايه در سطح تشابه ژنتيكي 70 درصد در چهار گروه اصلي (A-D) قرار گرفتند. به طوري كه جدايه ‏هاي دودمان ‏هاي همسانه اي A-D به ترتيب به گونه‏هاي C. karstii، C. fructicola، C. gloeosporioides و C. aenigma تعلق داشتند. براي اطمينان از صحت شناسايي، تعداد 28 جدايه از دودمان‏ هاي كلوني مختلف به عنوان نماينده براي شناسايي مولكولي بر اساس تعيين توالي ناحيه ژني بتاتوبولين (TUB2) و فاصله بين ژني APN2/MAT1 (ApMAT) انتخاب شدند. تجزيه و تحليل تبارزايي صحت شناسايي و نيز كارآمدي نشانگر مولكولي ISSR به عنوان يك ابزار مفيد در گروه بندي و تفكيك برخي گونه ‏هاي غالب جنس Colletotrichum را نشان داد.