بررسي گستره ژنومي خانواده ژني CIPK در گياه هالوفيت آلوروپوس ليتوراليس (.Aeluropus littoralis L)

شبكه سيگنالينگ CBL- CIPK يكي از مهم‌ترين سيستم‌هاي انتقال سيگنال در گياهان بوده كه سيگنال‌هاي كلسيم ناشي از تنش‌هاي محيطي مختلف را رمزگشايي مي‌كند. پروتئين‌هاي متصل به يون كلسيم به‌عنوان مولكول‌هاي حسگر عمل نموده و با دريافت سيگنال‌هاي يون كلسيم سلولي، وظيفه هدايت پيام را به آبشارهاي ژني پايين‌دست بر عهده دارند. تحمل بالقوه تنش‌هاي غيرزنده خصوصاً تنش شوري و قرابت آن به غلات، انگيزه اصلي بسيار از محققين براي مطالعه مكانيسم‌هاي مولكولي گونه هالوفيت Aeluropus littoralis است. در اين تحقيق با توجه به در دسترس قرار گرفتن توالي ژنومي اين گياه، شناسايي اين‌سيليكو اعضاي خانواده ژني AlCIPK و ارزيابي پاسخ‌هاي بياني آن‌ها در برابر تنش‌ شوري مدنظر قرار گرفت. بر مبناي همولوژي با ژن‌هاي آرابيدوپسيس، 20 ژن CIPK در ژنوم A. littoralis شناسايي شد. تجزيه‌وتحليل جانمايي پروتئين‌ها نشان داد كه اين پروتئين‌ها در بخش‌هاي مختلف سلولي فعال هستند. درخت فيلوژنتيك بر مبناي توالي پروتئيني 20 AlCIPK، 26 AtCIPK و 33 OsCIPK، نشان داد كه 79 CIPK موردبررسي از رابطه ارتولوژيكي قوي برخوردارند. آناليز فيلوژنتيكي بر اساس تجزيه‌وتحليل ساختار اگزون / اينترون، همه AlCIPK‌ها را به دو گروه كماينترون و غني اينترون تقسيم نمودند. الگوهاي بيان متمايز اعضاي خانواده ژني AlCIPK انشقاق عملكردي و ساختاري اين ژن‌ها را در طي تكامل تأييد مي‌كند. يافته‌هاي اين بررسي ضمن ارائه برخي خصوصيات عملكردي خانواده ژني سنسورهاي كلسيم، اطلاعات پايه‌اي را براي تحقيقات آتي در مورد كاركرد بيولوژيكي اين ژن‌ها فراهم مي‌سازد.