عنوان مقاله :
بررسي تنوع ژنومي ارقام پسته مقاوم و حساس به آفت پسيل با استفاده از روش توالييابي كل ژنوم
پديد آورندگان :
سعادتي جبلي ، مرضيه دانشگاه فردوسي - دانشكده كشاورزي - گروه بيوتكنولوژي , مرعشي ، حسن دانشگاه فردوسي - دانشكده كشاورزي - گروه بيوتكنولوژي , شهرياري ، فرج الله دانشگاه فردوسي - دانشكده كشاورزي - گروه بيوتكنولوژي , سيفي ، عليرضا دانشگاه فردوسي - دانشكده كشاورزي - گروه بيوتكنولوژي , فكرت ، ليدا دانشگاه فردوسي - دانشكده كشاورزي - گروه گياه پزشكي
كليدواژه :
پسته , تنوع نوكلئوتيدي , توالييابي كل ژنوم , مقاومت به آفت , GATK
چكيده فارسي :
پسته يكي از مهمترين محصولات باغي است كه به دليل دوپايه بودن و هتروزيگوسيتي بالا، داراي تنوع ژنتيكي زيادي است، از اين رو شناسايي تنوع ژنتيكي موجود در بين ژنوتيپهاي پسته در جهت اصلاح و توليد ارقام مقاوم به پسيل اهميت ويژهاي دارد. پسيل پسته يكي از مهمترين آفات درخت پسته است كه پوره و حشرات بالغ اين آفت با مصرف شيره گياه سبب افزايش ميزان پوكي، عدم خنداني و همچنين كاهش عملكرد ميشود. در اين پژوهش چندشكليهاي تكنوكلئوتيدي و حذف و اضافه كوچك در چند رقم ايراني پسته حساس (اكبري، كله قوچي، احمدآقايي، ممتاز) و مقاوم (بادامي زرند، حاج عبداللهي، ايتاليايي، سرخس) به پسيل مورد بررسي قرار گرفت. ابتدا خوانشها با ژنوم مرجع همرديف شدند و سپس چندشكليهاي تكنوكلئوتيدي و حذف و اضافههاي كوچك مشخص شدند. درصد همرديفي خوانشها با ژنوم مرجع بالاي 96 درصد بود كه نشان دهنده كيفيت بالاي همرديفي بود. ارقام حساس به ترتيب داراي 2920688 و 701109 و ارقام مقاوم داراي 2919898 و 701000 چندشكلي تكنوكلئوتيدي و حذف و اضافه كوچك بود. در مجموع، نتايج تجزيه و تحليل دادهها نشان داد كه تنوع ساختاري و چندشكلي تكنوكلئوتيدي و حذف اضافه كوچك ژنوم در ارقام حساس بيشتر از ارقام مقاوم است.
عنوان نشريه :
مهندسي ژنتيك و ايمني زيستي
عنوان نشريه :
مهندسي ژنتيك و ايمني زيستي