مطالعهmiRNA هاي درگير در تنش‌هاي شوري و خشكي و هستي‌شناسي ژن‌هاي هدف در گونه‌هاي Brassica

هدف: رشد و عملكرد گياه به‌طور چشمگيري تحت تأثير تنش‌هاي غير زيستي  مانند خشكي و شوري قرار مي‌گيرد. گياهان براي انطباق و تحمل تنش شوري و خشكي كه ممكن است بقاي آن‌ها را در طول چرخه زندگي آن‌ها تهديد كند، راهكارهايي را بكار مي‌برند كه يكي از آن‌ها تنظيمات پس از رونويسي باواسطه miRNAاست.مواد و روش‌ها: بدين منظور در تحقيق حاضر، براي بررسي اين پديده در گياه كلزا ابتدا با بررسي منابع miRNAهايي كه در طي تنش‌هاي شوري و خشكي بيان معني‌داري از خود نشان داده بودند انتخاب شدند. به‌منظور بررسي و مقايسه روابط تكاملي و حفاظت‌شدگي MicroRNA مؤثر در تنش خشكي و شوري در سه گونه Brassica napus، Brassica rapa و Brassica oleracea درخت فيلوژنتيكي براي آن‌ها رسم شد. به كمك نرم‌افزار آنلاين psRNATarget شناسايي ژن‌هاي هدف براي miRNAهاي انتخاب‌شده صورت گرفت. دسته‌بندي و بررسي هستي‌شناسي ژن‌هاي هدف انجام شد. به‌منظور انجام تفسير و تحليل جامعي از روابط بين ژن‌هاي هدف، شبكه ميانكش پروتئين‌ها ترسيم شد. در پژوهش حاضر 225 ژن هدف براي miRNA ها شناسايي شد.نتايج: پس از بررسي شبكه ميانكش پروتئين‌ها مشخص شد كه بيشترين تعاملات بين زير واحدهاي ريبوزومي، پروتئازومي و سيستم يوبيكوئيتينپروتئازوم وجود داشت. اين نتيجه گوياي اين است كه، تنش خشكي و شوري منجر به فعال شدن سيستم‌ها و مسيرهاي مختلف بيولوژيكي و تغيير در بيان ژن‌ها همراه با فعال شدن ماشين پروتئين‌سازي و تغيير در محتواي پروتئيني مي شود و گياه از طريق فعال كردن تنظيم ژن پس از رونويسي و تغييرات پس از ترجمه، فراواني، فعاليت‌ها، تقسيم‌بندي درون‌سلولي و انتقال پروتئين‌هاي تنظيم‌كننده درگير در فرآيندهاي مختلف رشد و همچنين پاسخ‌دهي به تنش را تنظيم مي‌كند.نتيجه‌گيري: نتايج اين بررسي ديد وسيع‌تري در ارتباط با تنش‌ها و اثر آن بر مسيرهاي درگير در فرآيندهاي سلولي خواهد شد و ابعاد گسترده پاسخ به تنش ها را آشكار خواهد كرد.