عنوان مقاله :
شناسايي و پيشبيني عملكرد RNAهاي بلند غيركدكننده پاسخگو به تنش خشكي در عدس (.Lens culinaris L)
پديد آورندگان :
خديور ، راضيه دانشگاه لرستان - دانشكده كشاورزي - گروه مهندسي توليد و ژنتيك گياهي , اسماعيلي ، احمد دانشگاه لرستان - دانشكده كشاورزي - گروه مهندسي توليد و ژنتيك گياهي , سهرابي ، سجاد دانشگاه لرستان - دانشكده كشاورزي - گروه مهندسي توليد و ژنتيك گياهي , ترابي پوده ، حسن دانشگاه لرستان - دانشكده كشاورزي - گروه مهندسي آب
كليدواژه :
تنش خشكي , عدس , PLncPRO , LncRNA
چكيده فارسي :
تنش خشكي يكي از مهمترين عوامل محيطي است كه بر رشد و بهره وري گياهان زراعي از جمله عدس تأثير ميگذارد. در طي تكامل، تغييرات ژنتيكي حياتي به وسيله RNAهاي غيركدكننده (ncRNAs) در پاسخ گياهان به تنش خشكي و ساير تنش هاي غيرزيستي بهوجود آمده است. در مطالعه حاضر، پس از شناسايي lncRNAها در پروفايل بياني عدس، از داده هاي RNA-seq و واكنش Real-time PCR براي بررسي الگوي بيان برخي از lncRNAهاي شناسايي شده تحت تنش خشكي استفاده شد. همچنين شبكه همبياني lncRNAs-DEGs با استفاده از بسته نرمافزاري psych ترسيم شد. در مجموع طي اين مطالعه، 3590 توالي lncRNA در عدس شناسايي شد. تعداد زيادي از lncRNAها با ژنهاي مرتبط با تنظيم ريتم شبانهروزي، پاسخ به يون روي، واكنش نوري فتوسنتزي و هموستازي يوني همبيان بودند. همچنين نتايج نشان داد كه سه توالي LCUL_evgLocus_104392، LCUL_evgLocus_99066 و LCUL_evgLocus_61876 داراي بيشترين تغيير بيان در پاسخ به تنش خشكي بودند. بررسي همبياني اين تواليها با ژنهاي داراي بيان افتراقي در پاسخ به خشكي سبب شناسايي مسيرهاي متابوليكي متأثر از اين تواليها گرديد. اين مطالعه براي اولين بار تواليهاي lncRNA را در عدس شناسايي نمود و گامي مفيد در شناخت مكانيسم عملكرد lncRNA در چگونگي تحمل گياهان به تنش خشكي ميباشد. شبكهها همبيان اين تواليها و ژنهاي داراي بيان افتراقي ميتواند سبب درك بهتر مكانيسمهاي پاسخ به خشكي در عدس شود.
عنوان نشريه :
پژوهش هاي ژنتيك گياهي
عنوان نشريه :
پژوهش هاي ژنتيك گياهي