شناسايي miRNAهاي حفاظت‌شده و ژن‌هاي هدف آنها در گل محمدي (Rosa damascena Mill.)

ژن هاي (miRNAs)، عناصر تنظيم‌كننده اي هستند كه نقش اصلي آنها كاهش بيان ژن در سطح mRNAها است. miRNA ها همچنين در چندين مسير گياهي مرتبط با فعاليت‌هاي مهم سلولي مانند رشد، تكثير، تمايز، مورفوژنز، آپوپتوزيز و پاسخ به تنش‌هاي غير زيستي و زيستي نقش‌هاي مهمي ايفا مي‌كنند. اين تحقيق به‌منظور شناسايي miRNAهاي حفاظت‌شده و ژن هاي هدف آنها با استفاده از داده هاي توالي‌يابي نسل جديد در گل محمدي (Rosa damascena Mill.) انجام شد. اگرچه روش‌هاي بيوانفورماتيك به‌عنوان كارآمدترين راهبرد براي شناسايي miRNA هدف توسعه‌يافته‌اند، راهبرد‌هاي آزمايشي با كارايي بالا هنوز بسيار مورد تقاضا هستند. براي شناسايي miRNAهاي جديد، پيش‌بيني و تعيين هستي شناسي ژن‌هاي هدف درگير در مسير توليد رايحه و رنگ در گل محمدي به ترتيب از ابزارهاي بيوانفورماتيكي Cmii، psRNATarget، WEGOو Blast2GO به علاوه روش‌ آزمايشگاهي (Real-time PCR) استفاده شد. با استفاده از داده‌هاي EST و RNA-seq مبتني بر همولوژي گياه Rosa lucieae در نهايت چهار خانواده miRNA، شامل: miR5021، miR2673، miR156 و miR838 به‌عنوان miRNAهاي نامزد انتخاب شدند. در مرحله بعد براي ارزيابي كمي Real-time PCR براي اعتبارسنجي سطح بيان miR5021 منتخب در دو نمونه (سفيد و صورتي) و مرحله بيولوژيكي (جوان و غنچه) گل محمدي، محلول‌پاشي با غلظت هاي صفر (شاهد) و 300 ميكرومولار متيل جاسمونات به مدت 48 ساعت بيشترين بيان نسبي miR5021 متعلق به نمونه صورتي‌رنگ را در مرحله نموي جوان نشان داد. اين يافته‌ها مطالعات چشم‌انداز آينده را در مورد سازوكارهاي تنظيمي miRNAها درRosa damascena سرعت مي‌بخشد.