آناليز شبكه هم‌بياني ترانسكريپتوم لوبيا به منظور شناسايي ماژول‌ها و ژن‌هاي هاب درگير در مقاومت به كنه تارتن دولكه‌اي

كنه تارتن دولكه‌اي (Tetranychus urticae Koch) از مهم‌ترين آفات تخريب‌كننده لوبيا (Phaseolus vulgaris L.) است. به‌طور كلي شبكه‌هاي ژني پيچيده‌اي در ايجاد حساسيت يا مقاومت در مقابل كنه تارتن دولكه‌اي دخيل هستند، بنابراين در اين تحقيق از روش سامانه‌هاي زيستي به‌كار برده شد. براي اين منظور از داده‌هاي RNA-Seq مربوط به تنش كنه تارتن روي گياه لوبيا استفاده شد. پس از فراهم‌كردن ماتريس بيان ژن‌ها، شبكه‌هاي مولكولي با استفاده از آناليز شبكه هم‌بيان وزن‌دار (WGCNA) مورد تجزيه و تحليل قرار گرفتند. پس از ايجاد ماژول‌ها، عملكرد ژن‌ها در هر ماژول مورد بررسي و تجزيه و تحليل قرار گرفت. بر اساس نتايج، مجموع 699 ژن با بيان افتراقي در پاسخ به تنش كنه تارتن شناسايي شدند كه در 7 ماژول هم‌بيان از طريق خوشه‌بندي سلسله‌مراتبي جاي گرفتند. بررسي هستي‌شناسي ژن‌ها و آناليز برهمكنش ژن‌هاي كليدي با استفاده از بانك اطلاعاتي String نشان داد پاسخ ترانسكريپتوم لوبيا به آلودگي با كنه تارتن بيشتر شامل ژن‌هاي كدكننده پروتئين كينازها، كاتاليزورها، فاكتورهاي رونويسي، ساخت متابوليت‌ها و مسيرهاي انتقال پيام هورموني بود. ماژول فيروز‌ه‌اي بيشترين ژن‌هاي درگير در مقاومت را دارا بود كه اين ماژول و ماژول زرد، بيشترين همبستگي را با رقم مقاوم به ترتيب پس از پنج و يك روز آلودگي داشتند. همچنين، ماژول مشكي بيشترين همبستگي با رقم حساس پس از پنج روز آلودگي را داشت. اين مطالعه دانش ما را از مكانيسم‌هاي مولكولي دخيل در مقاومت به كنه تارتن افزايش مي‌دهد. همچنين ژن‌هاي بررسي شده در اين تحقيق مي‌توانند به‌عنوان اهداف اصلاحي براي ايجاد مقاومت معرفي شوند.