شناسايي ژن هاي اختصاصي كارسينوم سلول كليوي و تاييد آزمايشگاهي بيان آن ها در رده سلولي ACHN در حضور توكسين seh باكتري استافيلوكوكوس اورئوس

مقدمه: كارسينوم سلول كليوي (RCC) شايع ترين نوع سرطان كليه در بزرگسالان است. هدف از مطالعه حاضر، دستيابي به ژن هاياختصاصي در RCC، بر اساس مطالعات بيوانفورماتيك و ارزيابي تغيير بيان ژن هاي شناسايي شده، در سلول هاي ACHN پس از ترانسفكت ژن توكسين seh باكتري استافيلوكوكوس اورئوس، است. روش كار: ابتدا همبستگي هاي بياني ژن هاي دخيل در RCC در پايگاه داده TCGA مورد بررسي قرار گرفت و شبكه تعاملات ژن ها ساخته شد. جهت تاييد تعاملات ژني شناسايي شده، مطالعات آزمايشگاهي در مدل سلولي ACHN انجام شد، به اين صورت كه ژن توكسين استافيلوكوكي seh در وكتور pcDNA3.1(+) كلون گرديد و درون سلول هاي ACHN ترانسفكت شد. پس از تاييد عملكرد صحيح وكتور نوتركيب در اين سلول ها و القاي آپوپتوز، بيان ژن هاي كانديد به روش real time RT- PCR ارزيابي شد. يافته ها: همبستگي هاي بياني ژن هاي دخيل در آپوپتوز توسط مطالعات in silico شناسايي شد و شبكه تعامل lncRNA-mRNA در RCC با موفقيت ايجاد شد. القاي آپوپتوز تحت تاثير بيان توكسين توسط فلوسيتومتري تاييد شد. بيان ژن هاي SOX9، SBF2/AS1، MAF و c-Maf در سلول هاي دستورزي شده با وكتور نوتركيب نسبت به سلول هاي شاهد، به صورت معناداري كاهش يافت. همچنين، افزايش بيان ژن هاي LINC00671 و LINC02499 در سلول هاي تراسنفكت شده با وكتور pcDNA3.1(+)-seh نسبت به گروه شاهد، مشاهده شد (p 0.05) و اين تغيير بيان تاييدي بر شناسايي دقيق ژن هاي درگير در آپوپتوز سلولي RCC بود. نتيجه گيري: نتايج بدست آمده نشان مي دهد كه شبكه هاي ژني شناسايي شده در اين مطالعه مي توانند چشم انداز جديدي براي تحقيقات با هدف تعيين مسير هاي مولكولي جديد و درمان RCC فراهم كند.