شناسايي نشانه‌هاي انتخاب مرتبط با مقاومت به بيماري يون (JD) در نژادهاي بز

پاراتوبركلوزيس يا بيماري يون (JD) يكي از بيماري هاي مهم مزمن التهاب روده اي در نشخواركنندگان است. هدف پژوهش حاضر، شناسايي نشانه هاي انتخاب با استفاده از آماره ناِاُريب تتا مرتبط با مقاومت به بيماري يون در دو نژاد بز جانيكا و سيريانا مي باشد. به اين منظور، مجموع 331 حيوان براي 53345 جايگاه نشانگري SNP با استفاده از تراشه هاي Caprine SNP50 BeadChip تعيين ژنوتيپ شدند. پس از كنترل كيفيت داده هاي اوليه در نهايت، 51182 نشانگر SNP و 326 رأس دام وارد آناليزهاي بعدي شدند. حيوانات مورد استفاده بر اساس آزمون آنتي بادي سرم خون (الايزا) در دو دسته مقاوم به بيماري يا سالم (162) و بيمار (164) گروه بندي شدند. با در نظر گرفتن صدك 9/99 كل ارزش هاي تتا، سيزده ناحيه ژنومي در نژاد جانيكا روي كروموزوم هاي 1، 5، 7 (دو منطقه)، 8، 9 (دو منطقه)، 11، 16، 17، 18 و 20 (دو منطقه) شناسايي شدند. همچنين، در نژاد سيريانا نواحي ژنومي روي كروموزوم هاي 3، 5 (دو منطقه)، 10، 12، 16، 17، 18، 23، 24 و 29 بالاتر از اين دامنه بودند، شناسايي شدند. بررسي ژن هاي گزارش شده در اين مناطق نشان داد كه در داخل يا مجاورت اين نواحي، ژن هاي IL4، IL13، TLR2، TLR4، IFNGR1، PGLYRP1، CHI3L2، PPFIBP1 و DENND5B قرار داشتند. بررسي بيوانفورماتيكي اين مناطق نشان داد، ژن هاي موجود در اين مناطق با سيستم ايمني، مقاومت به بيماري و عفونت باكتريايي، پاسخ به استرس اكسيداتيو و سركوب سرطان مرتبط هستند. نتايج اين تحقيق مي تواند منبع اطلاعاتي ارزشمندي در زمينه شناسايي مناطق ژنومي و در نتيجه، ژن هاي مرتبط با بيماري يون در نژادهاي مختلف بز فراهم آورد.