رديابي هم‌زمان دو گونه ويروس رگبرگ زرد نكروتيك چغندرقند و ويروس سوختگي سياه چغندرقند با استفاده از واكنش زنجيره‌اي پلي‌مراز دوگانه

تاكنون ويروس‌هاي رگبرگ زرد نكروتيك چغندرقند (Beet necrotic yellow vein virus, BNYVV) و سوختگي سياه چغندرقند (Beet black scorch virus, BBSV) به‌طور مجزا در ريشه‌هاي آلوده از مزارع چغندرقند ايران رديابي شده‌اند. هدف از اين مطالعه رديابي همزمان دو ويروس ذكرشده به‌منظور صرفه‌جويي در زمان و انرژي در فرآيند تشخيص آلودگي بود. بدين منظور از سه روش استفاده شد. در روش اول (روش رايج): ويروس‌ها با استفاده از واكنش زنجيره‌اي پلي‌مراز با ترانويسي معكوس (RT PCR) به‌وسيله آغازگرهاي اختصاصي مربوط به هر كدام و مجزا از يكديگر روي ريشه آلوده رديابي شدند. در روش هاي دوم و سوم، اين دو ويروس به ترتيب با استفاده از واكنش زنجيره‌اي پلي‌مراز با ترانويسي معكوس به‌صورت تكي (Simplexrt PCR) اما هم‌زمان در يك ترموسايكلر و به صورت دوگانه (DuplexRT PCR) با به كارگيري دو جفت آغازگر اختصاصي رديابي شدند. نتايج در روش هاي دوم و سوم نشان داد كه با بهينه‌سازي دماي اتصال آغازگرهاي اختصاصي (56 درجه سانتي‌گراد) مبتني بر ناحيه ژن كد كننده پروتئين پوششي، به ترتيب قطعات هدف 391 و 453 جفت بازي از ژنوم BNYVV و BBSV تكثير مي‌يابند. در نتيجه اين دو روش جهت رديابي هم‌زمان مناسب بوده و ازنظر صرفه‌جويي در زمان و انرژي مقرون‌به‌صرفه است و همچنين قابليت استفاده از آن‌ها به‌منظور تهيه نقشه پراكنش در مناطق كشت چغندرقند و نيز ارزيابي و شناسايي لاين هاي مقاوم چغندرقند در برنامه‌هاي به نژادي در شرايط گلخانه وجود دارد.