پويش كل ژنومي براي شناسايي نواحي ژنومي مرتبط با انتشار متان در گاو با استفاده از تراشه 30K

در سطح جهاني 60-50 % متان از بخش كشاورزي توليد مي‌شود كه بويژه حيوانات نشخواركننده در اين ميان نقش كليدي دارند. در اين ميان متان نقش بسيار قوي در گرم شدن جهان دارد به طوري كه توانايي اين گاز در گرم كردن كره زمين 25 برابر دي اكسيد كربن مي‌باشد و بعد از گاز دي‌اكسيد كربن، متان دومين گاز گلخانه‌اي از لحاظ مقدار مي‌باشد. هدف از تحقيق حاضر پويش كل ژنومي براي شناسايي نواحي ژنومي موثر بر متان پيش‌بيني شده براساس غلظت اسيدهاي چرب فرار مايع شكمبه در گاو هلشتاين ايران بود. در اين راستا مو و مايع شكمبه (از طريق لوله مري) از 150 راس حيوان بر اساس روش ارزش‌هاي اصلاحي صفت توليد شير دوطرفه نمونه‌گيري شد. بعد از اندازه‌گيري غلظت اسيدهاي چرب فرار مايع شكمبه، انتشار متان به ازاي هر حيوان با استفاده از اين اسيدها اندازه‌گيري شد. DNA حيوانات با GGP-LD v4 SNP panel (حاوي SNPs30٬108) ژنوتايپ شدند. در اين مطالعه SNPs14 معني‌دار مرتبط با صفت انتشار متان در كروموزم‌هاي 1، 2، 6، 8، 10، 15، 17 و 18 شناسايي گرديد. Annotating براي شناسايي Quantitative trait locus (QTL)‌هاي اطراف اين SNP‌هاي معني‌دار، يكسري QTL‌هاي مرتبط با شير توليدي و تركيب‌هاي آن، وزن بدن و خوراك مصرفي باقي‌مانده اطراف بعضي از اين SNP‌ها را نشان داد. اين نتايج نشان دهنده پتانسيل انتخاب ژنتيكي براي كاهش انتشار متان به ازاي هر حيوان را نشان مي‌دهد به طوري كه بهبود حاصل از انتخاب ژنتيكي به دليل توارث‌پذيري، تجمعي و دائمي بودن بسيار مفيد مي‌باشد.