پويش ژنومي نشانه هاي انتخاب در گوسفندان پوستي و پشمي ايراني با استفاده از روش هاي برآوردگر نااُريب FST و hapFLK

بررسي نشانه هاي انتخاب در كل ژنوم به شناسايي ساز و كارهاي انتخاب و تشخيص مناطقي از ژنوم كه طي ساليان متمادي به صورت طبيعي و يا مصنوعي انتخاب شده اند، كمك مي كند. هدف از اين پژوهش، شناسايي نقاطي از ژنوم در گوسفندان پوستي و پشمي بود كه طي سال هاي مختلف انتخاب شده اند. بدين منظور، 80 رأس گوسفند پوستي (قره گل، سياه كبود و كبوده شيراز) و پشمي (سنجابي، كرماني و بلوچي) با استفاده از آرايه هاي گوسفنديk 600 تعيين ژنوتيپ شدند. براي شناسايي نشانه هاي انتخاب از آزمون نااُريبFST (تتا) و آزمون hapFLK استفاده شد .نتايج تتا، 26 منطقۀ ژنومي روي كروموزوم هاي 1، 2، 6، 19 و 24، و نتايج hapFLK، هفت منطقه ژنومي روي كروموزوم هاي 6 و 19 شناسايي كرد. تجزيه و تحليل اطلاعات زيستي (بيوانفورماتيكي) نشان داد كه برخي از اين مناطق ژنومي با ژن هاي مؤثر بر صفات رنگدانه و مشخصات پشم (KIT، MITF، IGSF10 و PDGFRA)، عضلات (MICALL2)، اتساع عروق و پاسخ ايمني (P2RY) و سرطان (MIR339، ELFN1، MAD1L1 و GPR87) هم پوشاني دارند. بررسي QTLهاي گزارش شده نيز نشان داد كه اين مناطق با QTLهاي صفات مهم اقتصادي از جمله صفات مرتبط با مشخصات گوشت، لاشه، شير، وزن بدن، تراكم استخوان و تعداد كل بره هاي متولد شده در ارتباط هستند. همچنين نواحي مورد انتخاب با مسيرهاي درگير در تمايز ملانوسيت و رنگدانه ها، تمايز سلول هاي بنيادي، فرآيندهاي سلولي، توسعه سيستم ايمني، سيستم خوني، فرآيندهاي باروري و سلولي ارتباط داشتند. به هر حال، براي شناسايي نقش دقيق ژن ها و QTLهاي شناسايي شده، لازم است مطالعات تكميلي انجام گيرد.