پويش كل ژنومي و تجزيه و تحليل غني‌سازي مجموعه‌هاي ژني مرتبط با صفات پشم در گوسفندان نژاد زندي

هدف پژوهش حاضر، شناسايي مناطق ژنومي و ژن هاي كانديداي مرتبط با صفات پشم از طريق پويش ژنومي برپايه آناليز مسير در گوسفند نژاد زندي بود. بدين منظور 96 رأس گوسفند با استفاده از آرايه هاي 50K تعيين ژنوتيپ شدند و براي هر دام ركوردهاي فنوتيپي شامل ميانگين قطر الياف، ضريب تغييرات قطر الياف، نسبت اليافي كه مساوي يا بيش‌تر از 30 ميكرومتر قطر الياف، طول استاپل، نسبت كمپ و نسبت مو در الياف اندازه‌گيري شد. ارزيابي پويش ژنومي براي صفات در نرم ا فزار GEMMA انجام شد، سپس با استفاده از بسته نرم افزاري biomaRt2 ژن هاي معني داري كه در داخل و يا 50 كيلوباز بالا و پايين‌دست نشانگرهاي معني دار قرار داشتند، شناسايي گرديد. در نهايت، آناليز غني سازي مجموعه هاي ژني به‌وسيله برنامه برخط KOBAS با هدف شناسايي عملكرد بيولوژيكي ژن هاي كانديدا انجام شد. در اين پژوهش ژن هاي مرتبط با صفات قطر الياف CEP290)، PRKCZ، TMTC3، RHPN2 و TNFSF4)، طول استاپل (NLGN1، SPHKAP و PLCE1) و نسبت كمپ و مو (FAT1 و PIK3R4) شناسايي شدند. در تحليل غني سازي مجموعه هاي ژني، تعداد 21 مسير با صفات پشم شناسايي شدند. از بين مسيرهاي زيستي شناسايي‌شده نقش مهمي در رشد و توسعه فوليكول هاي مو، توليد كراتينوسيت ها، رشد و توسعه اپيدرمال، سنتز آنزيم هاي تروئونين كينازها و مسير سيگنال دهي  Wntداشتند. با توجه به تأييد نتايج قبلي و شناسايي ژن‌هاي كانديداي جديد با عملكرد مولكولي مرتبط با صفات الياف پشم، نتايج اين پژوهش مي تواند در درك سازوكار ژنتيكي كنترل كننده صفات پشم مورد استفاده قرار گيرد و در انتخاب ژنتيكي گوسفند از طريق كيفيت بالاتر پشم مفيد باشد.