پويش كل ژنومي مرتبط با صفات سن ميش در اولين بر‌ه‌زايي و فاصله بين دو زايش در گوسفندان زندي

هدف: سن ميش در اولين زايش و فاصله بين دو زايش از مهم‌ترين صفات توليدمثلي مؤثر بر سودآوري سيستم‌هاي پرورش گوسفند است. فلذا هدف پژوهش حاضر، شناسايي مناطق ژنومي مؤثر بر سن ميش در اولين بره‌زايي و فاصله بين دو زايش ميش‌هاي نژاد بومي زندي با استفاده از آرايه‌‌هاي ژنومي 50K مي‌باشد.مواد و روش‌‌ها: بدين منظور از اطلاعات ژنوتيپي 96 رأس از ميش‌هاي نژاد زندي و ركوردهاي فنوتيپي مرتبط با صفات مورد مطالعه استفاده گرديد. مراحل مختلف كنترل كيفي و شناسايي نشانگرهاي SNP مستقل بوسيله‌ نرم‌افزار PLINK انجام شد. پس از مراحل مختلف كنترل كيفي، 94 رأس حيوان و 36070 نشانگر براي آناليزهاي بعدي شناسايي شدند. آناليز پويش كل ژنومي بر پايه مدل خطي مختلط براي صفات توليدمثلي در نرم‌ا‌فزار GEMMA انجام شد. سپس با استفاده از نرم‌افزار Genome Data Viewer پايگاه برخط NCBI براساس آخرين اسمبلي (ARS UI_Ramb_v2.0) ژن‌هاي معني‌داري كه در داخل و يا 300 كيلوباز بالا و پايين دست نشانگرهاي معني‌دار قرار داشتند، شناسايي شدند. در نهايت، براي شناسايي عملكرد بيولوژيكي ژن‌‌هاي نزديك به مناطق انتخابي از طريق پايگاه‌‌هاي برخط GeneCards و UniProtKB استفاده شد.نتايج: در اين پژوهش تعداد هفت نشانگر تك نوكلئوتيدي واقع روي كروموزوم‌‌‌هاي 1، 2، 3، 6، 11 و 23 شناسايي شدند. همچنين ژن‌هاي UMPS،‌ITGB ،‌SMARCAL1‌،‌APAF1، UGT8 و ST8SIA5 كه با صفات توليد مثلي در ارتباط هستند، در اين مناطق قرار داشتند. برخي از اين ژن‌هاي شناسايي شده در مناطق ژنومي معني‌دار با مطالعات قبلي هم‌خواني داشت. با بررسي‌هاي بيشتر در پايگاه‌هاي برخط نشان داد شناسايي شده نقش مهمي در فرآيند تخمك‌اندازي، رشد و توسعه عضلات اسكلتي، رشد ابتدايي جنين و سن بلوغ داشتند. نتيجه ‌گيري: نتايج اين تحقيق مي‌تواند در درك ساز و كار ژنتيكي كنترل كننده صفات توليدمثلي مورد استفاده قرار گيرد و با توجه به تأييد مناطق قبلي پويش ژنومي و شناسايي مناطق ژنومي جديد، استفاده از يافته‌هاي اين پژوهش مي‌تواند در انتخاب ژنتيكي گوسفند از طريق كاهش سن ميش در اولين بره‌زايي مفيد باشد.