همسانه‌سازي و بررسي بيوانفورماتيكي ژن UGT در زعفران(Crocus sativus L.) ايران

آپوكاروتنوئيدها عامل ارزش اقتصادي در گياه زعفران هستند، بنابراين جداسازي و مطالعه ژن‌هاي درگير در متابوليسم آپوكاروتنوئيدها از اهميت ويژه‌اي برخوردار است. در اين تحقيق، باتوجه به اهميت ژن CsUGT در بيوسنتز كروسين و به منظور شناخت بيشتر خصوصيات پروتئين CsUGT، اقدام به جداسازي، همسانه‌سازي و انتقال اين ژن به باكتري E.coli سويه DH5α شد. بدين منظور، ابتدا توالي‌ پروتئيني ژن‌ مورد نظر بدست آمد و سپس ويژگي‌هاي فيزيكي و شيميايي و فيزيولوژي پروتئين‌ CsUGT توسط سرورها و ابزارهاي Protparam، SOPMA، ProtScale، Pfam، ProtComp، SignalP، TMHMM و ChloroP بررسي شد. همچنين با استفاده از سرور Swiss-Model ساختار سه‌بعدي اين پروتئين مورد بررسي قرار گرفت و جهت اعتبار سنجي ساختاري مدل ترسيم شده سه‌بعدي، نمودار راماچاندران ترسيم گرديد. با توجه به نتايج حاصل، پروتئين CsUGT داراي ثبات در دماهاي بالا، قطبي و فاقد دمين آب‌گريز مي‌باشد . اين پروتئين داراي 462 اسيد آمينه و حاوي توالي حفاظت شده پروتئين‌هاي خانواده گليكوزيل‌ترانسفراز است. پروتئين CsUGT فاقد ‌ پپتيدهايي با نقش سيگنالي يا سيگنال‌هاي اتصال دهنده است و جايگاهي سيتوپلاسمي دارد. اين تحقيق امكان جداسازي ژن CsGTS زعفران را فراهم و شرايط انتقال آن را به داخل ناقل بهينه نمود. علاوه بر اين، نتايج تجزيه و تحليل ساختار پروتئين CsUGT زمينه را براي مطالعات عملكردي آتي فراهم مي‌كند و مي‌تواند اطلاعات با ارزشي در رابطه با رفتار و واكنش اين آنزيم‌ در مسير سنتز آپوكاروتنوئيدهاي زعفران فراهم كند.