بررسي شبكه تنظيمي ژن‌هاي مؤثر بر صفات توليد و تركيبات شير گوسفند با استفاده از مطالعات پويش كل ژنومي (GWAS)

امروزه به‌منظور بهره‌گيري از نتايج تحقيقات مرتبط با مطالعات پويش كل ژنومي (GWAS) و استفاده از آن در جهت ترسيم شبكه‌هاي تنظيم ژني، مطالعات جديدي در حال انجام مي‌باشد كه مبناي آن استفاده از الگوريتم‌هاي ماتريس AWM است (Reverter و Fortes، 2013). در مطالعه حاضر، شبكه‌هاي ژني از طريق الگوريتم‌هاي ماتريسAWM -PCIT و ارتباط SNPها با فنوتيپ‌هاي توليد و تركيبات شير گوسفند ترسيم شد. بدين منظور از داده‌هاي توليد و تركيبات شير ‌469 رأس ميش نژاد Valle del Belice و اطلاعات ژنوتيپي ‌37228 SNP استفاده شد. داده‌هاي فنوتيپي شامل 5328 ركورد روز آزمايش براي 6 صفت توليد شير (مقدار توليد، ميزان و درصد چربي، ميزان و درصد پروتئين و تعداد سلول‌هاي بدني شير) بود و شبكه تنظيم ژني با استفاده از برنامه cytoscape رسم شد. نتايج نشان داد كه استفاده از الگوريتم‌هاي AWM-PCIT از بين ژن‌هاي شناسايي موجود، كه در ارتباط مستقيم و غيرمستقيم با صفات مرتبط با شير بودند ژن‌هاي OSBPL3، ERBB4، VGLL4، BAZ1A، DDX25، CDH23، ITSN2، DPY30، FAT3 و CAPN10 شناسايي شدند. همچنين نتايج نشان داد كه از بين 10 ژن شناسايي شده، ژنDDX25 ارتباط بيشتري با ژن هاي ديگر دارد نتايج مطالعه حاضر و ساير مطالعات نشان داد كه فرآيند پيچيده توليد و تركيبات شير تحت تأثير شبكه تنظيم ژني بيش از 10 ژن مهم و ارتباط با تعداد زيادي از ژن‌هاي ديگرقرار دارد و با توجه به تأييد نتايج حاصل از مطالعه قبلي در زمينه‌ي پويش ژنومي صفات توليد و تركيبات شير، و شناسايي مناطق ژنومي جديد مرتبط با اين صفات، استفاده از يافته‌هاي اين تحقيق، مي‌تواند در انتخاب ژنتيكي گوسفند مفيد باشد.