بررسي تنوع گونه اي دو عقرب Androctonus crassicauda و Hemiscorpius lepturus با استفاده از ژن هاي متابوليسمي متفاوت بيان شده در داده هاي RNA-seq

راسته عقرب ‏ها جزء رده عنكبوتيان و شاخه بندپايان دسته بندي مي شوند. با توجه به اين كه مطالعات گسترده اي در سراسر جهان در حوزه فيلوژنتيكي و مورفولوژيكي در حال انجام است، دسته بندي عقرب ها نيز در حال به روز رساني مي باشد. اين مطالعه در سال 1400 انجام گرديدد. هدف از پژوهش حاضر، بازسازي شبكه متابوليسمي عقرب‌هاي Androctonus crassicauda و Hemiscorpius lepturus با استفاده از مطالعات RNA-seq و معرفي ژن هاي متابوليسمي كليدي متفاوت بيان شده بين دو گونه عقرب به عنوان نشانگر ملكولي براي ارزيابي تنوع ژنتيكي بين گونه هاي مختلف عقرب بود. صيد عقرب ها با استفاده از نور فرابنفش و در نواحي مختلف استان خوزستان انجام شد (10 نمونه از هر گونه). سم‌گيري از عقرب‌ها به روش شوك الكتريكي انجام شد و پس از گذشت 72 ساعت از سم‌گيري، غده زهر جداسازي و با استفاده از هاون چيني و ازت مايع پودر گرديد. استخراج RNA از غده زهر با استفاده از كيت تجاريRNeasy Animal Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA, USA) طبق دستور العمل شركت انجام گرديد. به اين منظور توالي يابي ترانسكريپتوم دو گونه عقرب انجام شد و تفاوت بيان ژن ها توسط نرم افزار RSEM آناليز گرديد. نتايج آناليز ها نشان داد كه در مجموع 688060 يوني ژن‌ در بين دو گونه شناسايي شدند كه از اين تعداد ۴۲۶۷۶ ژن داراي تفاوت بيان معني‌داري بودند (0/05 p). هستي شناسي ژن‌هاي متفاوت بيان شده با استفاده از پايگاه هاي KEEG و GO انجام شد و نتايج نشان داد كه ژن هاي دخيل در مسير متابوليسمي بيش ترين فراواني را دارا مي باشند. بازسازي شبكه متابوليسمي عقرب و تجزيه و تحليل آن با استفاده از پايگاه داده استرينگ و نرم افزار سايتواسكيپ منجر به شناسايي 5 ژن هاب متابوليسمي گرديد. در نهايت با استفاده از توالي اسيد آمينه اي ژن هاب، (تريوز فسفات ايزومراز، سيترات سنتاز، گلوگز 6- فسفات ايزومراز، كاتالاز و انولاز) درخت فيلوژنتيكي بين 7 گونه عقرب ترسيم شد. اين تحقيق استفاده از اين 5 ژن متابوليسمي را بر اي بررسي روابط فيلوژنتيكي در عقرب ها كارآمد ارزيابي كرد.