غربالگري مجازي مبتني بر ساختار با توان بالا جهت انتخاب تركيب(تركيبات) شيميايي مهاركننده‌ي جديد عليه كمپلكس فاكتور رونويسي FOXM1 با ترادف ژنومي هدف

پروتئين FOXM1 به عنوان يك فاكتور رونويسي مهم، در عملكردهاي متنوعي ازجمله كنترل بيان ژن‌هاي مختلف، انتقال سلول‌ها به فاز تقسيم، آنژيوژنز، مهاجرت و غيره درگير مي‌باشد و بيش‌بيان آن در انواع مختلف سرطان گزارش شده است. بنابراين، اين پروتئين يك هدف دارويي بالقوه در درمان سرطان مي‌باشد. تاكنون، داروها و تركيبات زيادي FOXM1 را هدف قرار داده‌اند، از جمله FDI-6 و RCM-1 كه عملكرد آن‌ها مهار ميان-كنش‌هاي FOXM1-DNA مي‌باشد. در اين مطالعه، به منظور پيش‌گيري از تشكيل كمپلكس FOXM1-DNA، زيرمجموعه In-vitro از پايگاه داده ZINC بصورت محاسباتي مورد بررسي قرار گرفت. براي دستيابي به اين هدف، ابتدا جايگاه‌هاي اتصال ليگاند در پروتئين، با اجراي الگوريتم MDpocket مورد جست و جو قرار گرفتند. قبل از محاسبه‌ي انرژي اتصال‌پذيري تركيبات به پاكت‌هاي پيش‌بيني شده، كتابخانه‌ها (حدود 260.000 تركيب) با استفاده از وب‌سرور FAF-Drugs4 بر اساس خواص فيزيكوشيميايي غربال شدند. پس از آن، تركيبات منتخب با استفاده از AutoDock VINA عليه پاكت‌هاي پيش‌بيني شده FOXM1 داك شدند. فرايند غربالگري بر اساس انرژي اتصال‌پذيري، هشدارهاي ساختاري و گروه‌هاي غير توكسيك طراحي شد. بر اين اساس، سه تركيب با انرژي داكينگ تقريبا مشابه، نمره‌ي عبور را بدست آوردند. جهت تمايز و رتبه‌بندي تركيبات انتخاب شده، روش MM/PBSA روي سه كمپلكس FOXM1-ليگاند اعمال شد و نهايتا، ليگاند1 بر اساس انرژي آزاد اتصال انتخاب شد. ليگاند معرفي شده در اين مطالعه، مولكول‌ hit جديد نويدبخشي است كه اميد مي‌رود ميان‌كنش FOXM1 با DNA مرتبطش را قطع كند. با اين حال، كوشش‌هاي تجربي بيشتري به‌منظور شناسايي ليگاند كشف شده به عنوان يك تركيب lead بايد انجام شود.