بررسي مسيرهاي سيگنالي متابوليسمي در سلول‌هاي بنيادي سرطان گليوبلاستوما به واسطه آناليز‌هاي بيوانفورماتيك

مقدمه:  گليوبلاستوما يكي از سرطان‌هاي شايع مغزي بوده كه نرخ مرگ و مير بالايي دارد. در اين مطالعه با استفاده از آناليز بيوانفورماتيك به بررسي و كانديد نمودن ژن‌هاي موجود در مسيرهاي متابوليسمي سلول‌هاي بنيادي گليوبلاستوما پرداخته شد.روش كار: در اين مطالعه با مراجعه به پايگاه داده GEO ديتاست مناسب براي آناليز انتخاب گرديد. اين ديتاست شامل پروفايل بيان ژني در سلول‌هاي بنيادي جدا شده از بيماران گليوبلاستوما بود. كلاسترهاي ژني با بيان بالا و پايين دسته‌بندي شدند. براي ارزيابي دقيق‌تر داده از پايگاه هاي داده غني همچون Enrichr، STRING و GEPIA استفاده شد. در نهايت ژن‌هايي كانديد و جدا شدند.يافته‌ها: 1250 ژن در مسير‌هاي بيوسنتز كلسترول، متابوليسم اينوزيتول تري فسفات، متابوليسم گرانيل گرانيل دي فسفات، بيوسنتز زيموسترول و متابوليسم فسفاتيديل اينوزيتول بيان بالا داشته و 1030 ژن در مسيرهاي كوندروييتين سولفات، درماتان سولفات، N استيل گلوكوزآمين، مسير گليكوليز بيان پايين داشتند. پس از ارزيابي ارتباط بين شبكه‌هاي پروتئيني، ژن‌هاي با بيان بالا و ژن‌هاي با بيان پايين انتخاب شدند. تمامي اين ژن‌‌ها در منحني بقاء، در بازه حدود 20 ماه، زنده ماني بيماران كمتر از 10% مشاهده شد.نتيجه‌گيري: نتايج اين مطالعه نشان داد كه ژن  DHCR7 به طور معني‌داري افزايش بيان داشته و ژن ENO2 نيز به طور معني‌داري كاهش بيان داشته و بقيه ژن‌ها افزايش بيان و كاهش بيان نسبي داشتند.