كاوش ژنومي نشانه هاي انتخاب جهت شناسايي مكان هاي كروموزومي مرتبط با بيماري يون در گاوهاي هلشتاين

انتخاب باعث ايجاد نشانه هاي انتخاب در سطح ژنوم مي شود. شناسايي نشانه هاي انتخاب در حيوانات در جهت ارتقا صفات اقتصادي و كاهش بيماريها، يكي از اصلي ترين و چالش برانگيزترين تحقيقات در زمينه ژنتيك جمعيت است. در اين تحقيق، با هدف شناسايي مناطق ژنومي تحت انتخاب مثبت بين جمعيت هاي گاوهاي مبتلا به بيماري يون و سالم هلشتاين، پويش گستره ژنوم با استفاده از چندشكلي هاي تك نوكلئوتيدي (SNP) انجام شد. اين تحقيق بر روي گاو هاي گاوداري فوكا در اصفهان بر روي 145 راس گاو هلشتاين انجام شد. بر اساس تراشه‌هاي 30K شركت ايلومينا تعيين ژنوتيپ و گاو ها به دو گروه بيمار و سالم گروه بندي شدند. گروه بيمار شامل 45 راس و گروه سالم شامل 100 راس گاو بود. در اين مطالعه براي شناسايي مناطق ژنومي تحت انتخاب از دو آماره FST و XP EHH استفاده شد. ژن هاي شناسايي شده توسط آماره FST در دو جمعيت بيمار و سالم شاملRAB37, ZC3H10, ESR1 HSD17B6, KCNC4, ERBB3 و NACA بودند. ژن هاي شناسايي شده توسط آماره XP EHH در دو جمعيت بيمار و سالم شاملAK1, ATP8A1, BTBD1, C1GALT1, CCDC6, CEP295, CLGN, CLSTN2, EHHADH,  ERBB4, FRK, GRID2, GRIP1 و LRP6  بودند. اكثر ژن هاي شناسايي شده در اين مطالعه با ايمني، بيماري هايي مثل سرطان، شيردهي، ماهيچه هاي اسكلتي، چرخه فحلي، مصرف خوراك، چسبندگي اسپرم و رشد در ارتباط بود، كه جزو صفات و ويژگي هاي مهم زيستي جاندار قرار مي گيرد. مطمئناً مطالعات گسترده تر با تعداد نمونه هاي بيشتر، درك بهتري از ژن هاي كانديد براي بيماري يون در گاو و طراحي برنامه هاي اصلاح نژادي موفق در جهت كاهش هزينه هاي ناشي از بيماري، ايجاد خواهد نمود.