مقايسه نشانگرهاي مولكولي RAPD، ISSR، ERIC در بررسي تنوع ژنتيكي قارچ phizocatonia solani AG1-IA

بيماري سوختگي غلاف برنج ناشي ازRhizoctonia solani AG1-IA ، يكي از مهمترين بيماري هاي قارچي برنج در شاليزارهاي شمال كشور مي باشد. با توجه به اهميت بيماري و عدم وجود اطلاعات جامع و كامل از ساختار ژنتيكي جمعيت هاي اين قارچ، تعيين نشانگر مناسب در بررسي تنوع ژنتيكي آن، ضروري به نظر مي رسد. در اين پژوهش دندروگرام حاصل از تجزيه و تحليل خوشه اي داده هاي RAPD، ISSR و ERIC، جدايه ها را در دو گروه كاملا مجزاي ژنتيكي قرار داد كه نتايج حاصل از تجزيه به مولفه اصلي نيز مويد اين مطلب بود. بعلاوه همبستگي مثبت و معني داري ميان ماتريس هاي تشابه حاصل از داده هاي RAPD، ISSR و ERIC با يكديگر و بطور مجزا مشاهده شد. نيكويي برازش خوشه بندي نيز در سطح بسيار خوبي قرار گرفت، به منظور تعيين كارايي نشانگرها، محتواي اطلاعاتي چندشكلي آنها (PIC) شاخص نشانگري (MI) و نسبت چندگانه موثر(EMR) محاسبه شد. شاخص هاي مورد بررسي در نشانگر ERIC بعلت استفاده از آغازگرهاي بلندتر و دماي اتصال بيشتر، نسبت به دو نشانگرISSR و RAPD در سطح بالاتري قرار گرفتند. يافته هاي اين مطالعه نشان مي دهد كه با وجود خصوصيات مشتركي نظير غالبيت، سادگي و سرعت عمل بالا در هر سه نشانگر RAPD، ISSR و ERIC و همچنين قدرت تفكيك جدايه ها به دو گروه كاملا مجزاي ژنتيكي، نشانگر ERIC قدرت بيشتري در آشكارسازي تنوع ژنتيكي جدايه ها دارد.