مقايسه خصوصيات بيولوژيكي و مولكولي جدايه ويروس رگه اي توتون (Tobacco streak virus) جدا شده از مزارع آفتابگردان ايران با جدايه هاي هندي و سوداني

A Comparison of Biological and Molecular Characterization of Sudanese-Faba Bean, Indian and Iranian-Sunflower Tobacco streak Virus Isolates

ويروس رگه¬اي توتون (Tobacco streak virus) متعلق به جنس ايلارويروس (Ilarvirus) بوده و به طيف وسيعي از گياهان از جمله آفتابگردان (Helianthus annus) كه يكي از گياهان دانه روغني مهم در بسياري از كشورها مي¬باشد خسارت وارد مي¬كند. در اين تحقيق در سال 2008 دو جدايه آفتابگردان و يك جدايه باقلا به ترتيب جدا شده از مزارع ايران، هند و سودان، جمع¬آوري شد و برخي از خصوصيات مولكولي و بيولوژيكي آنها مورد مقايسه قرار گرفت. وزن مولكولي پروتئين پوششي سه جدايه با استفاده از روش SDS-PAGE، 9/30 كيلودالتون تعيين شد. آزمون وسترن بلات اين نتايج را تأييد كرد. در شرايط آزمايشگاهي ويروس قادر به آلوده سازي در برخي گياهان بود. دامنه ميزباني و ميزان علايم ايجاد شده توسط اين سه جدايه متفاوت بود. با استفاده از آزمون TAS-ELISA و آنتي¬بادي مونوكلونال TSV (AP-696 DSMZ) هيچ تنوع سرولوژيكي مشاهده نشد. براي هر جدايه يك قطعه 747 نوكلئوتيدي با پرايمر اختصاصي ناحيه CP تكثير شد. آناليز توالي نوكلئوتيدي و اسيد آمينه پروتئين پوششي اين جدايه‌ها نشان داد كه جدايه ايراني و جدايه سوداني با هم در يك گروه قرار مي¬گيرند و جدايه هندي با حدود 91% تشابه در گروه جداگانه‌اي قرار مي‌گيرد.

Sunflower, (Helianthus annuus) is considered as an important oilseed crop grown in many countries including Iran. In recent years, Tobacco streak virus (7W) has been found in sunflower fields in Iran. 7s V is a type member of Ilarviruses, and infects a wide range of crops as well as weeds. In this survey and during 2008, two isolates of sunflower and one isolate of faba bean collected from, Iran, India and Sudan respectively were taken for a study where some of the biological and molecular characterization of these isolates were compared. The molecular weights of coat protein of the isolates (employing SDS-PAGE) were estimated as 30.9 kDa. Western blotting confirmed the results. In laboratory inoculation tests, the virus was found to infect some plants. The host range and diversity of symptoms were different in the three isolates. In TAS-ELIA test, no serological diversity observed among the isolates using 7W monoclonal antibody (AP-696 DSMZ). A fragment of 747nt was amplified for each isolate through the specific primer pair of the CP region. Following the cloning and sequencing of the fragments of each isolate, phylogenetic analysis with nucleotide and amino acid sequences of coat protein of these isolates revealed that Iranian and Sudanese isolates being close to each other stood in one group whereas the Indian isolate with 91% similarity belonged to another. E-mail: samin_hf@yahoo.com Keywords: Tobacco streak virus, Coat protein, TAS-ELISA, Sunflower, Western blot