تعيين گونه‌هاي اكينوكوكوس گرانولوزوس جدا شده از كيست‌هاي هيداتيد با رديابي ژن ميتوكندرياي atp6

تعيين گونه‌هاي اكينوكوكوس گرانولوزوس جدا شده از كيست‌هاي هيداتيد با رديابي ژن ميتوكندرياي atp6

زمينه و هدف : گونه‌هاي اكينوكوكوس گرانولوزوس بر پايه خصوصيات مرفولوژيكي، ويژگي ميزبان واسط و يا بررسي ژنتيكي DNA ميتوكندريال يا هسته‌اي آنها مشخص مي‌شوند. اين مطالعه به منظور تعيين گونه‌هاي اكينوكوكوس گرانولوزوس جدا شده از كيست‌هاي هيداتيد با رديابي ژن ميتوكندرياي atp6 انجام شد. روش بررسي : در اين مطالعه توصيفي 60 كبد و ريه آلوده گاو، گوسفند و بز از كشتارگاه شهرستان ورامين در سال 1387 جمع‌آوري شدند. پروتواسكولكس‌ها از كيست‌هاي بارور جدا و DNA آنها استخراج گرديد. دو جفت پرايمر جديد كه به طور اختصاصي تمام ژن atp6 ميتوكندريال گونه‌‌هاي G1و G6 (دو گونه موجود در ايران) اكينوكوكوس گرانولوزوس را تكثير مي‌كرد؛ طراحي و آزمايش گرديد. يافته‌ها : پرايمرهاي جديد، ژنوتايپ‌هاي G1 و G6اكينوكوكوس گرانولوزوس را تكثير كرده و به ترتيب باندهاي اختصاصي bp 708 و bp705 حاصل گرديد. ژنوتايپ G1 در تمام نمونه‌هاي كيست بارور شناسايي شد. نتيجه‌گيري : اين مطالعه نشان داد كه ژن atp6 ميتوكندريال گونه‌‌هاي G1و G6ماركر مولكولي مناسبي براي بررسي تفاوت‌هاي ژنتيكي در ايزوله‌هاي اكينوكوكوس گرانولوزس جدا شده در ميزبانان موجود در ايران مي‌باشد. همچنين نتايج نمونه‌هاي سكانس شده در اين مطالعه نشان داد كه توالي‌هاي حاصل مشابه توالي‌هاي گزارش شده قبلي براي اين گونه‌ها مي‌باشد.

Background and Objective: Several strains of the Echinococcus granulosus have been described based on morphological characters, intermediate host specificity and/or genetic analysis of mitochondrial and nuclear DNA. The aim of this study was to characterize different E.granulosus isolates by using sequences of mitochondrial atp6 gene. Materials and Methods: In this study, Sixty infected liver and lungs of cattle, sheep and goats were collected from the abattoir of Varamin city-Iran during 2008. Protoscoleces were removed from each fertile cyst and DNA extracted. New and specific primers were designed for two existing genotypes (G1 and G6) of E. granulosus known to occur in Iran and applied in PCR reactions. Results: The new primers selectively amplified the G1 and G6 genotypes of E. granulosus with specific bands of 708 and 705 bp respectively. The G1 genotype was identified in all fertile cyst samples. Conclusion: This study showed that the new primer pairs which specifically amplify portions of the mitochondrial atp6 gene of the G1 and G6 strains of Echinococcus granulosus are proper molecular marker for investigating genetic variation in a number of isolates of E. granulosus from a range of hosts (sheep, goats, cattle) in Iran. The result of sequenced samples showed that our sequences were the same as those reported previously for these strains.