شناسايي ژن هاي پلازميدي aatA aap , aggR ,در ميان عفونت هاي اشريشيا كلي دستگاه ادراري در آزمايشگاه هاي غرب تهران

سابقه و هدف: عفونت ادراري با اشريشياكولي يكي از عفونتهاي باكتريايي بسيار شايع مي باشد. هدف از اين مطالعه بررسي توزيع سه ژن بيماري زاي aggR ، aap و aatA و پيوستگي آن با ژن stbA در عفونت هاي (Uropathogenic Echerichia coli ) UPEC بود. روش بررسي: 244 نمونه E.coli از افراد مبتلا به عفونت ادراري از آزمايشگاه هاي باليني غرب تهران در سال هاي 1387 و 1388 جمع آوري گرديد. جداسازي باكتري E.coli بر اساس روشهاي آزمايشگاهي استاندارد انجام گرفت. پس از استخراج DNA از نمونه ها، حضور ژن هاي بيماري زاي aap ، aggR ، aatA و stbA به روش PCR بررسي گرديد. يافته ها: از ميان 244 نمونه UPEC ، 104 نمونه فاقد اين سه ژن بيماري زا بودند، درحالي كه در 14 نمونه ژن stbA مشاهده گرديد. به علاوه، از ميان 140 نمونه UPEC داراي ژن بيماري زا، 94 نمونه (6/46 درصد) ژن aap، 52 نمونه (23 درصد)ژن aggR و 80 نمونه (4/35 درصد) ژن aatA را به تنهايي يا همراه با يكديگر حمل مي كردند. همچنين حضور ژن stbA در 140 نمونه حاوي ژن يا ژن هاي بيماري زا پايدار نبوده و تنها در 44 نمونه مشاهده گرديد. نتيجه گيري: نتايج ما نشان مي دهد الگوي ابراز ژن هاي بيماري زاي پلازميدي aggR، aapو aatA در E.coli در قسمت هاي باليني مختلف تغيير مي نمايد. اين سه ژن بيماري زا از مكان اصلي روي پلازميد خارج شده و در مكان ديگري قرار گرفته است. به هرحال اين مطالعه نشان مي دهد كه هر سه ژن aggR , aap و aatA تنها به سويه هاي EAEC محدود نمي شود.

Background: Urinary tract infection with E.coli (UPEC) is one of common bacterial infections. This study investigates the distribution of three pathogenic genes, including aggR, aap and aatA and their linkage with the gene stbA (gene essential for maintaining Plasmid pAA) in UPEC infections. Materials and methods: E.coli samples from 244 patients with urinary tract infection were collected from clinical laboratories in west of Tehran (Iran) between 2008 and 2009. E.coli isolation was performed with standard laboratory methods. DNA was extracted from samples and the presence of pathogenic genes aap, aggR, aatA and stbA was investigated by PCR method. Results: Among 244 UPEC samples, 104 samples did not have any of three pathogenic genes, but 14 samples carried stbA gene. Among 140 UPEC samples with pathogenic genes, 94 (46.6%) aap gene, 52 (23%) aggR gene and 80 (35.4%) aatA gene were identified alone or in combination with each other. Also, the presence of stbA gene in 140 samples containing pathogenic gene or genes was not persistent as only 44 samples had this gene. Conclusion: Our results showed that the pathogenic plasmid aggR, aap and aatA gene patterns in E.coli change in different clinical settings. These three genes exit from one loci on plasmid and locate elsewhere. This study also showed that aggR, aap and aatA genes are not restricted to EAEC strains.