بررسي كارآيي ماركر VNTR ژن PAH براي شناسايي ناقلين فنيل كتونوري در جمعيت استان يزد

سابقه و هدف: تعدد جهش در ژن PAH ‌ (عامل PKU) باعث مي شود كه در بسياري از موارد تشخيص جهش بيماري زا امكان پذير نباشد. در اين موارد براي شناسايي ناقلين از پلي مورفيسم‌هاي درون و نزديك ژن PAH استفاده مي‌شود. VNTR (Variable Number of Tandem Repeat) يكي از ماركرهاي چند آللي ژن PAH مي باشد. در اين مطالعه، فراواني و توزيع آلل هاي VNTR ژن PAH در كليه مبتلايان PKU شناخته شده استان يزد تا ابتداي سال 1387 مورد بررسي قرار گرفت. روش بررسي: 24 نفر شامل 9 فرد مبتلا به PKU و خواهران و برادران سالم و والدين آنها مورد ارزيابي قرار گرفتند. پس از استخراج DNA از خون افراد، قطعه حامل VNTR ژن PAH به كمك روش PCR تكثير و با تكنيك الكتروفورز بررسي شد. يافته ها: در مجموع 6 نوع آلل VNTR در جمعيت PKU استان يزد ديده شد كه تنها 4 آلل آن در كروموزوم هاي جهش يافته وجود داشت. آلل هاي داراي 3، 7، 8 و 12 تكرار به ترتيب با فراواني 5/5، 11، 78 و 5/5 در كروموزوم هاي جهش يافته و آلل هاي داراي 3، 7، 8، 9، 11 و 12 تكرار به ترتيب با فراواني20، 20، 33، 13، 7 و 7 در كروموزوم هاي سالم مشاهده شدند. PIC براي جمعيت مورد بررسي 63 درصد بدست آمد. نتيجه گيري: PIC محاسبه شده براي جمعيت مورد بررسي نشان مي دهد كه در اين منطقه در بيش از دو سوم موارد با بررسي ماركر VNTR امكان تشخيص ناقلين در بستگان بلافصل وجود دارد

Background: Due to the large number of PKU-causing mutations in the phenylalanine hydroxylase gene, it may be not possible to detect the mutation. In these cases, segregation analysis of the variable number tandem repeat (VNTR) polymorphic marker associated with this gene is applied in carrier detection of PKU. Considering the population heterogeneity in Iran, we undertook to investigate allelic frequencies of this marker in the province of Yazd (central Iran) until beginning of 2008. Materials and methods: 24 people, including 9 patients and their parents and siblings, were studied. After DNA extraction from their blood, PCR and gel electrophoresis for VNTR containing fragment was carried out. Results: Totally, 6 VNTR alleles were identified. Only 4 of them were present in mutant chromosomes. The distribution of PKU alleles in chromosomes was as follows: 5.5% VNTR3, 11.0% VNTR7, 78.0% VNTR8 and 5.5% VNTR12. In non-PKU chromosomes, alleles were distributed as follows: 20.0% VNTR3, 20.0% VNTR7, 33.0% VNTR8, 13.0% VNTR9, 7.0% VNTR11 and 7.0% VNTR12. Polymorphic information content (PIC) of this marker was calculated at 63%. Conclusion: This PIC indicates that it is a suitable marker for carrier detection of PKU in the first degree relatives of population under study.