الگوي rep-PCR استرين هاي Pectobacterium جدا شده از سيب زميني داراي علايم بيماري-هاي پوسيدگي نرم و ساق سياه در استان همدان

rep -PCR Pattern of the Strains of Pectobacterium Isolated From Potato Soft Rot and Black Leg Diseases in Hamedan Province

استرين هاي وابسته به باكتري جنس Pectobacterium از مهم ترين عوامل بيماري زاي گياهي به ويژه سيب زميني هستند. در استان همدان همه ساله گونه هاي مختلف اين باكتري زيان هاي فراواني را به بار مي آورند. از مناطق مختلف كشت سيب زميني در استان همدان نمونه هاي مشكوك و داراي علايم بيماري هاي پوسيدگي نرم و ساق سياه گردآوري و استرين هاي باكتريايي مشابه Pectobacterium رو ي محيط كشت EMB جدا و خالص سازي شدند. پس از اثبات بيماري زايي استرين هاي باكتري روي سيب-زميني، تعداد 27 استرين براي بررسي ويژگي هاي فنوتيپي به منظور شناسايي، انتخاب شدند. استرين هاي باكتريايي مورد بررسي بر اساس ويژگي هاي بيماري زايي و فنوتيپي از هم ديگر متمايز بودند. بر مبناي ويژگي هاي فنوتيپي بيشتر استرين هاي عامل بيماري سيب زميني به عنوان Pectobacterium carotovorum و تعدادي نيزPectobacterium atrosepticum شناسايي شدند. انگشت نگاري ژنومي استرين هاي انتخاب شده به روش rep-PCR با استفاده از دو آغازگرERIC وBox انجام شد. داده هاي به دست آمده با استفاده از نرم افزار NTSYS V 2.2 و روش تجزيه خوشه اي UPGMA آناليز شد. نتايج حاصل نشان داد كه استرين هاي مورد آزمايش P. carotovorumو تعدادي نيز P. atrosepticum هستند. بررسي الگوي rep-PCRروشي سريع براي تشخيص و رديابي استرين هاي Pectobacterium بيماريزاي سيب زميني است.

Bacteria belong to Pectobacterium genus cause important diseases on some plants especially potato. They are agents for economically crop losses in Hamedan province anuualy. From the main potato growing area in Hamedan province diseased potato samples showing soft rot and black leg disease symptoms were collected and bacterial strains were isolated on EMB medium. Pathogenicity of the isolated straind verified on potato seedlings and 27 strains for characterization of phenotypic features as representatives which were determined based on the standard bacteriological methods. Results indicated that tested strains were differenciable based on their phenotypic feautures which mainly identified as Pectobacterium carotovorum and few as Pectobacterium atrosepticum. Genomic fingerprinting of the representatives by rep-PCR using ERIC and Box primers were determined. Obtained DATA were analyzed by NTSYS V.2. 2 software and UPGMA cluster analysis using Jacard coefficient. Results showed that most of the tested strains are P. carotovorum and a few as P. atrosepticum. Rep-PCR patten analysis is a quick technique for detection and identification of Pectobacterium strains pathogenic on potato.