بررسي تنوع ژنتيكي ارقام مختلف پنبه با استفاده از ماركرهاي مولكولي rapd

Investigation of Genetic Diversity in Cotton Cultivars using RAPD Markers

بررسي تنوع ژنتيكي ارقام مختلف پنبه با استفاده از ماركرهاي مولكولي RAPD فرزانه تفويضي*1، مسعود شيدايي2، فرح فراهاني3 1 استاديار، گروه زيست شناسي، دانشكده ي علوم زيستي، دانشگاه آزاد اسلامي واحد پرند، تهران- ايران 2 استاد، گروه زيست شناسي، دانشكده ي علوم پايه، دانشگاه شهيد بهشتي، تهران- ايران 3 استاديار، گروه زيست شناسي، دانشكده ي علوم، دانشگاه آزاد اسلامي واحد قم، قم- ايران چكيده سابقه و هدف: پنبه يكي از مهم ترين محصولات گياهي در ايران است و در نواحي مختلفي كشت مي شود. كشت مداوم يكسري از ژنوتيپ ها منجر به فرسايش ژنتيكي در دراز مدت مي گردد، بنابر اين مطالعه تنوع ژنتيكي و معرفي ارقامي با تنوع ژنتيكي بالا امري مهم و ضروري است. مواد و روش ها: در اين مطالعه تنوع ژنتيكي ده رقم مختلف پنبه تتراپلوييد (.Gossypium hirsutum L) با استفاده از روش مولكولي RAPD مورد ارزيابي قرار گرفت. يافته ها: از 30 پرايمر مورد بررسي، 22 پرايمر باندهاي قابل ارزش گذاري توليد نمودند. در مجموع، 387 باند حاصل شد كه 178 باند پلي مرف بودند. پرايمر OPM11 بيشترين باند پلي مرف و پرايمر OPC09 بيشترين باند اختصاصي را توليد كردند در حالي كه بعضي از پرايمرها هيچ باند اختصاصي نداشتند. بعضي ارقام داراي باندهاي اختصاصي بودند. بيشترين باند اختصاصي متعلق به رقم سي اكرا بود (6 باند). نتيجه گيري: گروه بندي ارقام با روش NJ انجام گرفت كه نشان دهنده تنوع ژنتيكي ارقام مورد مطالعه براساس ماركرهاي مولكولي RAPD بود. بر اساس دندروگرام رسم شده دو رقم والديني سي اكرا و نازلي داراي بيشترين تشابه ژنتيكي (bootstrap %100) با يكديگر بودند. كلمات كليدي: .Gossypium hirsutum L, ماركرهاي RAPD، تنوع ژنتيكي

Investigation of Genetic Diversity in Cotton Cultivars using RAPD Markers Tafvizi F1*, Sheidaei M2, Farahani F3 1Department of Biology, Faculty of science, Islamic Azad University, Parand Branch, Tehran 2 Department of Biology, Faculty of seience, Shahid Beheshti University, Tehran 3Department of Biology, Islamic Azad University, Qom Branc. Abstract Aim and Background. Cotton is considered as one of the most important crop plants in Iran, cultivated in various regions of the country. Continuous cultivation of the same genotypes may bring about genetic erosion in the long term; therefore study of the available genetic variability as well as introducing the new ones is of importance. Materials and Methods. Molecular study was performed in 10 tetraploid cotton cultivars (Gossypium hirsutum L.S). Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) profiles for ten cotton genotypes were generated with 30 random primers. Results. Out of 30 primers used 22 primers produced reproducible bands. The primers generated 387 RAPD loci, of which 178 were polymorphic. The primer OPM11 produced the highest number of Polymorphic bands and Primer OPC90 produced the highest number of unique bands while some of the primers produced no unique band at all. Siokra cultivar produced the highest unique bands (6). Conclusions. NJ clustering methods performed on molecular data. Two parental cultivars of Nazilli and Siokra are grouped together with 100% bootstrap value in NJ dendrogram. Key words. Gossypium hirsutum L., genetic diversity, RAPD markers *Corresponding Author; Address: Department of Biology, Faculty science, Islamic Azad University, Parand Branch, Tehran Email:farzaneh.tafvizi@yahoo.com