كاربرد نشانگرهاي ريزماهواره براي مطالعه ژنوم گوسفند كرماني

Application of Microsatellite Markers for a Study of Kermani Sheep Genome

گوسفند كرماني يكي از نژادهاي اصلي گوسفند در ايران، به ويژه در استان كرمان است كه تاكنون از طريق نشانگرهاي ريزماهواره ويژه كروموزوم Y مطالعه نشده است. در اين پژوهش وضعيت تكثير 17 نشانگر ريزماهواره ويژه كروموزوم Y گاوي در گوسفند كرماني مورد مطالعه قرار گرفت. تعداد صد قوچ و 20 ميش غيرخويشاوند به طور تصادفي انتخاب و خون‌گيري انجام شد. استخراج DNA با استفاده از كيت DNA Purification Kit انجام شد. واكنش‌هاي PCR با تمام آغازگرها با موفقيت انجام شد. همه آغازگرها، يعني UMN2303، UMN0929، UMN0907، INRA124، INRA189، INRA057، BM861، UMN0108، UMN0307، UMN2405، UMN0301، UMN2706، UMN3008، UMN0406، UMN0504، UMN2713 و UMN0803 چندشكل بودند. در مجموع 102 آلل در اين 17 ريزماهواره شناسايي شد كه بيشترين و كمترين باندهاي مشاهده شده به ترتيب مربوط به جايگاه هاي INRA124 (16 باند) و UMN2303 (5 باند) بود. نتايج اين پژوهش نشان داد كه مي توان از ريزماهواره هاي ويژه كروموزوم Y گاوي به منظور تعيين تنوع ژنتيكي در گوسفند استفاده كرد.

Kermani sheep breed is one of the major sheep breeds in Iran, especially in Kerman province for which no study has yet been carried out through Y-chromosome specific microsatellite markers. Throughout this study, amplification quality related to 17 bovine Y-chromosome specific microsatellites was evaluated for the mentioned sheep breed. One hundred males and twenty females of non-related animals were randomly selected and blood sampled. Genomic DNA was isolated from blood using DNA Purification Kit. PCR reactions making use of all the 17 primers were successfully done. All the primers, UMN0803, UMN0929, UMN0108, UMN3008, UMN0307, UMN0907, UMN2303, UMN0301, UMN0406, UMN0504, UMN2405, UMN2706, UMN2713, INRA057, INRA124, INRA189, and BM861 are found out to be polymorphs. In total, 102 alleles were observed in these 17 microsatellites, the highest, and the lowest number of which were observed in INRA124 (16 alleles) and UMN2303 (5 alleles), respectively. The results of this research indicated that bovine Y-chromosome specific microsatellites can be employed for a determination of the genetic diversity in sheep.