تعيين تنوع ژني اشريشياكلي از آب چاه پاركهاي تهران با روش مولتي پلكس PCR

Determination of genotype variation of Escherichia coli in well water of Tehran’s parks by Multiplex PCR

سابقه و هدف: آب نقش عمده‌اي در زمينه بهداشت عمومي داشته و آب آلوده داراي اثرات مستقيم بر سلامت انسان مي‌باشد. با توجه به نقش پر اهميت اشريشياكلي‌هاي مولد اسهال (ETEC, EHEC, EIEC, EPEC) در كودكان، و كاربرد روشهاي فنوتيپي در آزمايشگاهها، اين سوال مطرح است كه E.coli‌هاي شناسايي شده جزو كداميك از E.coli‌هاي مولد اسهال مي‌باشند؟ هدف از اين مطالعه شناخت وضعيت آلودگي ميكروبي آب چاه پاركهاي تهران، و تعيين انواع پاتوتايپ اشريشياكلي‌هاي مولد اسهال مي‌باشد. مواد و روشها: 165 نمونه آب چاه پاركها از 5 منطقه جغرافيايي شمال، جنوب، شرق، غرب و مركز تهران در شرايط استريل نمونه‌برداري و جهت بررسي با فيلتر غشايي و تعيين انواع پاتوتايپ‌هاي E.coli به آزمايشگاه بخش ميكروب‌شناسي دانشكده بهداشت منتقل گرديد. يافته‌ها: نتايج بدست آمده نشان مي‌دهد كه90 نمونه (5/54%) از آبهاي تهيه شده آلوده به E.coli بودند. نمونه‌هاي آب چاه در جنوب تهران درصد آلودگي بيشتري نسبت به ساير نقاط داشته است. نتايج تكميلي با مولتي پلكسPCR نشان داد كه از 90 نمونه آلوده به E.coli، تنها 67 سويه DEC جدا شد، كه به ترتيب 42 سويه (7/62%) EPEC، 12 سويه (9/17%) STEC (يا EHEC)، 9 سويه (4/13%) به عنوان سويه‌هاي EIEC و 4 سويه (6%) به عنوان سويه‌هاي ETEC شناخته شدند. نتيجه‌گيري: حضور پاتوتايپ‌هاي مختلف در نمونه‌هاي آب چاه پاركها مي تواند بر اهميت استفاده از علايم هشداردهنده و آموزش مردم بويژه كودكان به هنگام بازي و استفاده از پاركها تاكيد نمايد.

Background and Aim: Water plays a major role in public health and the contaminated water has direct effect on human health. E.coli is an indicator of water pollution; different strains of E.coli such as ETEC, EHEC, EIEC and EPEC can cause diarrhea in children. The aim of this study is to investigate the contamination rate of well water of Tehran’s parks, and pathotyping E.coli strains which cause diarrhea. Materials and Methods: 156 well water samples from five different geographical parts of Tehran (north, south, east, west, and the centre) were collected aseptically. The collected samples were transferred to the laboratory in microbiology section, School of Public Health, for membrane filtrations and patotyping. Results: 90 out of 156 samples (54/5%) were contaminated with E.coli. The samples from south part were more contaminated compared to others. Out of 90 isolated E.coli only 67 were DEC, in which 42 (62.7%) were detected as EPEC, 12 (17.9%) as STEC or ETEC, 9 (13.4%) as EIEC and 4 (6%) as ETEC by PCR method. ‍Conclusion: Presence of different biotypes of E.coli in well water of parks can be dangerous, especially for children; thus, placing warning signs and educating people in this regard should be taken seriously.